Родословная петра 1 схема: Всё, что нужно знать о Петре I, в 8 пунктах • Arzamas

Содержание

Морской путь Петра I из Воронежа

 

 

Проект межрегионального тура

 

"Морской путь Петра I из Воронежа"

 

Санкт-Петербург - Воронеж  - Ростов-на-Дону

 

 

 

 

 Маршрут «Морской путь Петра I из Воронежа» проходит через

всю европейскую часть России и связывает через Воронеж Санкт-Петербург с Ростов-на-Дону,

символизируя завоевание выхода России в Чёрное море

флотом, построенным в Воронеже.

 

Санкт-Петербург, как город, получивший

в Воронеже благословение на строительство от Митрофана,

митрополита Воронежского.

 

Проект заслужил высокую оценку экспертов

по внутреннему туризму на федеральном уровне и

занял 2 место в финале Всероссийской Премии «Маршруты России - 2019»

 

 

 

 

 

 

  В Воронеже появились:

 

  • Первое адмиралтейство

 

 

  •  Первый линейный корабль. .. 

     

 

 

 

 

 

 

Здесь представлены экскурсии региона Воронежского края

 

 

экскурсии регионов

Санкт-Петербурга и Ростова-на-Дону

на данном сайте будут представлены позднее  

 

 

1. Воронеж - степная столица морской державы 

Воронеж - Таврово - Новоживотинное - Рамонь - Воронеж

 

 

2.  Петр I в Костенках - родине первого европейца 

Воронеж - Костёнки - Острогожск - Воронеж

 

 

3.  Родина военно-морского флота и Андреевского флага 

Воронеж - Белогорье - Павловск - Воронеж

 

 

4.  Покоритель Азова с берегов Воронежа 

Воронеж - Липецк - Чаплыгин - Воронеж

 

 

5. Богучар - петровские родники жизни 

Воронеж – Богучар – Белая горка – Воронеж

 

 

 

  

 

Программа - трансформер 

 

Вы можете выбрать любые из представленных экскурсий, 

чтобы составить программу на любое количество дней

 

 

 

Программы маршрутов:

 

1.  Воронеж - степная столица морской державы

Воронеж - Таврово - Новоживотинное - Рамонь - Воронеж

 

 

 Экскурсионная программа № 1 - 1 день  (10 часов)

 

Воронеж – колыбель российского флота

  • Экскурсия по городу с посещением музея-корабля «Гото Предестинация»

 

Таврово. Легенды забытой петровской верфи

  • От «дублера» воронежских верфей до Центра кораблестроения, от села Тавровки до города-крепости Тавров
  • Витус Беринг, адмирал Федор Апраксин, адмирал Федор Ушаков
  • Пройду по Доковой, сверну на Корабельную…
  • Школьный музей с реликвиями петровских времен
  • Лев Тургенев – «Тавровский генерал» Елецкого мушкетерского полка

 

Усадьба  Веневитиновых на берегу ДОНА

  • Животинный источник Петра I
  • Борода  воронежского боярина и Бритва-реликвия
  • Тайна старинного перстня …
  • Поэт-романтик Дмитрий  Веневитинов
  • Вальс Веневитинова в музыкальной гостиной
  • Пушкин. Оленины. Оболенские. Войнич

 

Рамонская верфь.  Корабли-баркалоны.  Дворец  Ольденбургских

  • «Меркурий» окольничего князя Львова
  • «Три рюмки»  и «Нептунус» боярина Стрешнева
  • Баркалон князя Долгорукова
  • Готический замок в центре Черноземья
  • Ольденбургские – ветвь династии Романовых
  • Бронзовая память о строителях флота 

 

 
 

 

2.   Петр I в Костенках - родине первого европейца 

Воронеж - Костёнки - Острогожск - Воронеж

 

 Экскурсионная программа № 2  - 1 день  (10 часов)

 

Костенки - прародина европейской цивилизации

  • «Армейская археология» Петра Первого
  • Эталонный памятник верхнего палеолита
  • Артефакты стоянки  первого европейца
  • Венере из Костёнок 22 тыс. лет
  • По следам вулканического пепла 40 тыс. лет
  • Дискуссии о происхождении человечества
  • Экскурсия на раскоп «Живая археология» (июнь-август)

 

Острогожск - Афины Воронежские

  • Пётр I и гетман Мазепа
  • Домик художника  И.Н. Крамского под камышовой крышей
  • Провинциальная «Третьяковка»  - подлинники работ Крамского, Куинджи, Айвазовского, Поленова
  • С.Я. Маршак - Рассеянный с улицы Садовой
  • Знаменитости Острогожска –  Троепольский, Станкевич, Рылеев…
  • Храм Архангела Михаила на Песках и его чудотворная икона Божией  Матери «Спорительница хлебов»

 

 

 

 

 

3  Родина военно-морского флота и Андреевского флага

Воронеж - Белогорье - Павловск - Воронеж

 

  Экскурсионная программа № 3  - 1 день (12 часов)

 

Павловск и династия морских офицеров

  • Павловск. Крепость и Императорские корабельные верфи 
  • От ботика Петра I до ракетного крейсера
  • Апраксин, Болховитинов, Сенявин, Ушаков –  великие сыны России
  • "Судостроение в эпоху Петра I" в музее военно-морского флота

 

Страна Белых гор    

  • Прогулка по Дону-батюшке на катере к Белым горам
  • Икона «Знамения» Божией Матери на створке морской раковины
  • Белогорский  мужской монастырь
  • Пещерный храм Подонья – самое крупное культовое подземелье

 

 

 

 

 

 

4  Покоритель Азова с берегов Воронежа

Воронеж - Липецк - Чаплыгин - Воронеж

 

Экскурсионная программа № 4  - 1 день  (12 часов)

 

Липецк - наследство Петра I

  • Липские железоделательные заводы от Петра I
  • «Липецкие минеральные воды» - один из первых в России курортов
  • Один город – два памятника Петру Великому и императорский отпечаток руки
  • Древне-Успенская церковь VII века – свидетельница петровских  преобразований

Раненбург - апельсиновая крепость

  • «Апельсиновая крепость» - подарок соратнику в делах великих
  • Созвездие царственных особ и слуг государевых
  • Тюремная крепость для избранных
  • Дом купца Григорьева и «обжорный» подвал
  • Троицкий собор от Петровских времён

 

 

 

 

5  Богучар - петровские родники жизни 

Воронеж – Богучар – Белая горка – Воронеж

 

   Экскурсионная программа № 5 -- 2 дня  ( 36 часов )

 

Эксклюзивная экскурсия в Богучар - ночь в санатории "Белая горка"!

Не часто выпадает возможность получить столько разноплановых эмоций: от увлекательной путевой информации и обзорной экскурсии по городу Богучар до возможности побывать в простом домике художника с мировым именем, услышать самые настоящие казачьи песни от самих казаков.

 

Экскурсионная программа "Богу чара!"

  • Добрая чарка от Петра I
  • «Живая вода» - целебное чудо Белой горки
  • История ремесел царя-реформатора
  • Богучарские гостинцы: «хохлома», семечки, куклы и не только…
  • Атаманская уха на берегу Тихого Дона
  • Картины мира Кищенко – слияние времен

 

 

 

 

Предлагаем сотрудничество турагентствам

 

Тур «Морской путь Петра I из Воронежа», как межрегиональный,

может быть дополнен вашими программами петровской тематики

по территориям, прилегающим к маршруту, и включать

достопримечательности вашего региона.

 

варианты сотрудничества:

 

  • Партнерство в формате агентского договора для привлечения туристических потоков на основе нового турпродукта.

 

  • Партнерство стратегическое по формированию совместного тура с включением объектов вашего региона.

 

 

 Вместе мы сильнее!

   

Ждем ваши предложения.

 

 

 

 

Официальный сайт Сергиевского района → История

                                                                                                                    Родословная современного Сергиевского района  начинается с военной крепости сооруженной в 1703 году по указу Петра I .
          На рубеже XVII-XVIII веков  Россия вела ряд изнурительных войн с Турцией и Швецией. Для изготовления пороха требовалась масса серы. Тогда-то и решили устроить в районе сокских кустарных промыслов серные заводы. Расположили их довольно компактно. Один находился у пригорода Сергиевска, второй, Новосергиевский (ныне Серноводск) - в 6 верстах от него,  а третий  - на реке Сургут.
           Для охраны этих заводов и была одновременно по соседству построена крепость Сергиевск.


          Однако если бы ее миссия сводилась только к этой задаче, она утратила бы свое предназначение вместе с прекращением производства серы на сергиевских заводах. А прекратилось оно очень скоро из-за нерентабельности.  В 1720 году Новосергиевский завод на Соку закрыли и перенесли на Самарскую Луку на Серную Гору в Жигулях. Судьба же остальных двух заводов так и осталась неизвестной.
            Построенная  крепость была названа именем преподобного Сергия Радонежского духовного заступника русской земли. Именами святых на Руси нарекались такие новые города и селения, на которые от роду возлагалась особо важная, государственная миссия. И именно такая роль  предназначалась  Сергиевскому городку.
          Именно в это время  петровская Россия вела тяжелые  войны с Турцией на юге и Швецией на севере. Вместе с тем она не забывала и о своих восточных и юго-восточных границах. По мере их продвижения на восток, строится целая система оборонительных сооружений, расположенных на подступах к Самаре.

         Первым таким сооружением стала Алексеевская крепость (1700 г.), названная в честь сына Петра I царевича Алексея (ныне поселок Алексеевка), вторым крепость Сергиевск. Но так как эти крепости были достаточно удалены друг от друга и не могли надежно охранять районы освоения, то, начиная с 1731 года, по Указу Сената  возводится Ново-Закамская линия крепостей, которая протянулась от Алексеевской крепости к Сергиевску и далее на север. Общая протяженность рвов, земляных валов и лесных засек Ново-Закамской линии составляла 230 км, из них 180 км проходили по нынешней территории Самарской области.
         Значительный отрезок Ново-Закамской линии составляла Сергиевская дистанция, то есть та ее часть, которая проходила по территории нынешнего Сергиевского района.        В центре этой дистанции стоял сам Сергиевский городок; южнее, по речке Орлянке, были построены четыре редута и фельдшанец; севернее, до вершины речек Липовка и Боровка, был также построен редут и сделаны лесные засеки. На землях, примыкавших к этой дистанции и оказавшихся под защитой Сергиевской крепости и ее редутов, появлялись новые поселения. Так возникли Елшанка, Чесноковка, Черновка, Нижняя Орлянка, Липовка и другие села Сергиевского района.
           Для строительства Сергиевской крепости был облюбован Казачий холм, возвышающийся над рекой Сок при впадении в нее степной речушки Сургут. Обе эти речки, да еще широкая старица Сока (ныне озеро Банное), служили естественной преградой на подступах к крепости при возможных набегах ногайцев с открытой восточной стороны. С севера и юга Сергиевск прикрывали расположенные в нескольких десятках километров крепости Кондурча и Красноярская, а на западе был уже Симбирск, была Россия.
         Первые сведения об основания Сергиевска были даны в книге П. И. Рычкова «Топография Оренбургская», изданной в 1862 году. Согласно описанию, «город был срублен из дубового леса, при том сделан был острог с четырнадцатью башнями и пять проездных ворот».
Однако в таком виде город просуществовал всего лишь год. Зимой 1703-1704 года Петр I новым указом повелел только что построенный город разобрать полностью, весной по воде отправить на Северный Кавказ и поставить на реке Терек под названием Терский городок.
         В Сергиевск же было прислано из разных волостей Казанского уезда четыре тысячи конных и пеших работников. Им велено было возвести на Казачьем холме земляной вал с уступами вышиною шесть метров, а на нем поставить тын из дубовых бревен с засыпкой из щебня. Внутри крепости, в ее юго-восточной части, находился острог, в центре деревянная церковь преподобного Сергия Радонежского Чудотворца с приделом и часовней, а рядом Соляной амбар и лавки для торговли солью. На земляном валу были установлены две пушки.
        Гарнизон и население крепости составили 215 семейств служилых людей из пригородов Старой Закамской линии. Кроме того, из Самары прибыл служилый человек Дмитрий Иванович Невежин с приданной ему сотней семей станичников, коему повелено было быть атаманом.
        Первым переселенцам  Сергиевской крепости жилось неспокойно. Восстали некоторые башкирские племена, вместе с ними поднялись татары, мещеряки и другие народности по рекам Каме и Белой, недовольные русской колонизацией их земель. Бунты охватили огромные пространства вплоть до  реки Самары. Восставшие разоряли дома помещиков, громили монастыри и церкви, захватывали поселенцев.       Забот у  гарнизона Сергиевской крепости хватало. Его солдаты не только денно нощно следили с крепостных башен за окрестными  холмами и долинами, но и непосредственно участвовали в отражении налетов степных племен.
         В 1737 году в  связи с расширением границ  Российского государства на восток и юго-восток Ново-Закамская оборонительная линия потеряла свою историческую значимость.  Сергиевск, просуществовав,  как военная крепость 35 лет, превратился в обычный штатный городок. Ныне сохранились лишь фрагменты этой крепости земляной вал на Казачьем холме.
          С середины XVIII века  Сергиевск входил в состав то Уфимского наместничества,  то  в составе Бугурусланского уезда во вновь образованную Оренбургскую губернию.   В 1851 году вместе с Бугурусланским уездом Сергиевск отошел к Самарской губернии, сменив статус пригорода на волостное село. И только в 1928 году село приобрело статус районного центра.
           Несмотря на свою заштатность село росло, крепло, опережая в своем развитии многих соседей.  В 1890 году население Сергиевска  составляло более 3 тысяч человек.  По мере роста населения довольно значительными темпами развивалась  производственная и социально-бытовая инфраструктура села.  Однако в начале и середине XIX века судьба обрушила на Сергиевск целый ряд бедствий: пожар 1806 года, в котором сгорели храм и большая часть домов, эпидемия холеры 1830 года, еще более разрушительный «Большой пожар»1848 года и, наконец, неурожай 1862-1863 года.
        Сергиевск стойко выдержал эти тяжелые удары судьбы, и уже к  концу XIX века  вернул себе славу одного из богатейших поселений. На 1 января 1890 года в Сергиевске были церковь и часовня,  16 заводов, 5 овчинных, маслобойня,  4 водяных мельницы.   Значение Сергиевска как торгового центра возросло с вводом железнодорожной ветки Кротовка Сургут, построенной под руководством Н.Г.Гарина-Михайловского и открытой в 1897 году.
          В 1902-1910  годы село становится крупным центром по скупке, вывозу и перевозке зерна. Извозчики-ломовики ежедневно отвозили на станцию Сургут до 5000 пудов хлеба.  Кроме маслобойного завода Романова и огромной паровой мельницы Юшкова, в селе работали салотопенный завод, кирпичные заводы, кожевенная мастерская, пекарня, колбасная. Вокруг базарной площади  сосредоточились магазины: бакалея и мануфактура Смирнова-Раймана-Смирнова, почта-магазин Кондурчина,  скобяные товары Романова, винный склад Баракиной, погреб рейнских вин.
      В течение последующих десятилетий XX века, как и вся Россия, Сергиевск пережил череду грозных событий первая мировая война, февральская и октябрьская революция1917 года, голод, разруха, Великая Отечественная война...

Реформы управления Петра I (таблицы и схемы)

Удобная навигация по статье:

Реформы государственного управления императора Петра 1

Петр I

Петровскими реформами центрального управления историки называют масштабные преобразования государственного аппарата, которые произошли в период правления Петра Первого. Основными нововведениями правителя считаются создание Правительствующего Сената, а также полной замены системы приказов Коллегиями, формирование царской Тайной Канцелярии Святейшего Синода.

Во время становления Петра на трон в качестве ключевого поста государственного управления выступали дворяне, которые получали свой чин по праву фамилии и происхождения. Пришедший к власти Пётр понимал, что устоявшаяся система правления – одно из слабых звеньев. Что именно она тормозит страну в её развитии.

Путешествие по Европе с 1697 по 1698 год царя в составе Великого Посольства позволило ему ознакомиться с системой административных органов в европейских государствах. На основе них он решает провести преобразования в России.

С началом петровской власти Боярская дума стала терять свою власть и впоследствии превратилась в рядовое бюрократическое ведомство. С 1701 года вся её работа была делегирована новому органу под названием «Консилия министров», которая представляла собой совет начальников самых важных правительственных органов. При этом, в её состав входило немало тех же бояр.

За два года до этого создаётся Ближняя канцелярия, контролирующая финансовые операции каждого приказа и принимающая административные решения. Все царские советники были обязаны подписывать важнейшие документы и регистрировать эти события в специальной книге именных указов.

Учреждение Сената

Второго марта 1711 года Петром Первым формируется так называемый Правительствующий Сенат, являющийся наивысшим органом административной, судебной и законодательной власти. На этот орган царь возлагал все свои обязанности на время своего отсутствия, ведь частые поездки из-за Северной войны не могли стать причиной остановки развития государства. При этом, данный управленческий орган был полностью подчинён царской воле и имел коллегиальную структуру, члены которой отбирались лично Петром. Двадцать второго февраля 1711 года была создана новая дополнительная должность фискала, который должен был осуществлять дополнительный надзор во время отсутствия царя за чиновниками.

Формирование и развитие коллегий происходит в период с 1718 по 1726 год. В них царь видел орган, способный заменить устаревшую систему медлительных приказов, которые, по большей части, лишь дублировали функции друг друга.

Появляясь, коллегии полностью поглощали приказы, а в период с 1718 по 1720 год президенты образованных Коллегий даже являются сенаторами и лично заседают в Сенате. Необходимо отметить, что впоследствии в Сенате остались лишь основные Коллегии:

  • Иностранных дел;
  • Адмиралтейства;
  • Военная.

Формированием вышеописанной системы коллегий завершается процесс бюрократизации и централизации государственного аппарата России. Разграничение ведомственных функций, а также общие нормы деятельности, регулирующиеся Генеральным регламентом – основное отличие обновлённого петровского аппарата от прежней системы управления.

Генеральный регламент

Царским указом от девятого мая 1718 года президентам трёх коллегий было поручено начать разработку документа под названием Генеральный Регламент, который бы являлся системой делопроизводства и имел в своей основе шведский устав. Данная система впоследствии стала называться «коллежской». Фактически регламентом утверждался коллегиальный способ обсуждения и решения дел, а также организацию делопроизводства и регулирование отношений с органами самоуправления и Сенатом.

Десятого марта 1720 года данный документ был одобрен и подписан правителем России Петром Первым. Устав включал в себя введение, а также пятьдесят шесть глав с общими принципами работы аппарате каждого государственного учреждения и разные приложения для толкования новых иностранных слов, которые были в тексте Генерального Регламента.

Святейший Синод

Перед окончанием Северной войны Пётр Первый начинает планировать свои церковные преобразования. Он приказывает епископу Феофану Прокоповичу начать разработку Духовного регламента и пятого февраля 1721 года царь одобряет и подписывает учреждение Духовной коллегии, которая впоследствии станет называться «Святейший Правительствующий Синод».

Каждый член данного органа был обязан лично присягнуть в верности царю. Одиннадцатого мая 1722 года появляется должность обер-прокурора, контролирующая деятельность Синода и докладывающая все новости правителю.

Создав Синод, государь ввёл церковь в механизм государства, фактически уподобив её одному из многих на тот момент существующих административных учреждений, наделённого определёнными функциями и обязанностями.

Схема управления государством при Петре I

Схема управления государством при Петра I

Таблица: реформы Петра I в сфере государственного управления

Дата реформы Содержание реформы
1704 год Была упразднена Боярская дума
1711 год Был учрежден Сенат (законодательные, контрольно-финансовые функции)
1700-1720 гг. Упразднение патриаршества и создание Святейшего Синода
1708-1710 гг. Реформа местного самоуправления. Создание губерний
1714-1722 гг. Создание прокуратуры, введение должности фискалов
1718-1721 гг. Замена приказов коллегиями
1722 год. Изменение системы престолонаследия (теперь монарх сам назначал себе преемника)
1721 год.  Провозглашение России империей

 

Реформы Петра I в сфере управления

Схема: местное самоуправления после реформ управления Петра I

Местное самоуправления после реформ Петра

Видео-лекция: Реформы Петра I в сфере управления

Фруктовый сад и огороды Стрельны / Государственный музей-заповедник "Петергоф"

Садово-огородный комплекс Стрельны был основан еще во времена Петра I. Деревянный дворец окружали сады со скотными дворами и конюшнями, рыбными прудами, плодовыми деревьями, ягодными и овощными грядками, теплицами, оранжереями и пасекой.  

В XVIII веке стрельнинские сады считались в России образцовыми.

Местные садоводы выводили новые сорта яблонь и ягодных кустов с учетом местных условий. Первая сохранившаяся садовая опись относится к 1733 году. Тогда на территории стрельнинской усадьбы находилось 3100 яблонь, 50 груш, 125 вишен, 200 кустов крыжовника и 400 кустов сирени, жасмина и роз. У подножия горки располагались оранжереи, теплицы и парники. В теплицах выращивали ананасы, дыни, арбузы, ранние огурцы и другие овощи. Огород располагался в низине у Карпиева пруда. Его вода использовалась для полива овощей, а весенними ночами туман, поднимаясь от нагревшегося за день пруда, накрывал огород, защищая его от заморозков.

По преданию, именно в Стрельне впервые высадили привезенные Петром из путешествия по Западной Европе "земляные яблоки" – так в ту пору называли картофель.

Выращивали в огороде и редис, и артишоки, и салаты-латуки. Известно, что Петр I привозил сам или поручал своим приближенным покупать за границей редкие сорта деревьев, кустарников, кадочных растений, семена цветов и овощей.

Ассортимент выращиваемых на огороде культур в настоящее время представлен традиционными русскими овощами: капустой, репой, редькой, морковью, свеклой, луком, чесноком, щавелем, хреном, укропом, сельдереем, а также картофелем, салатами-латуками, редисом, артишоком, завезенными Петром из Европы. Кроме того, выращиваются кабачки, патиссоны, тыквы, помидоры.

Одной из особенностей огорода, созданного при Петре, является наличие пряных и лекарственных растений, выращиваемых на одной грядке. Эта традиция идет из Голландии, а потому получила в России название "Огород на голландский вкус". Ароматные травы представлены мятой, майораном, мелиссой, любистоком, тмином, тимьяном, базиликом, кориандром, сельдереем, петрушкой. Лекарственная грядка состоит из валерианы, пустырника, зверобоя, тысячелистника, подорожника, череды и шалфея.

Рядом с огородом находился Пчельник с соломенными, деревянными и стеклянными ульями. По преданию, Петр завел в Стрельне пасеку, чтобы доказать, что пчелы могут жить недалеко от моря. Первые улья, скорее всего, были привезены царем из Дерпта. Стрельнинские крестьяне, увидав их, создали русский вариант пчелиного домика – дуплянку. На зиму домики заносились в бревенчатый сарай. Содержали пчел в Стрельне более ста лет. Ныне на территории Фруктового сада поставлены липовые борти как напоминание о бывшем здесь когда-то пчельнике. В летнее время по огороду проводятся отдельные экскурсии, и у посетителей есть возможность ощутить пьянящий аромат душистых трав, увидеть на грядках разнообразные по цветовой гамме овощные культуры. Фруктовый сад особенно привлекателен в пору цветения плодовых деревьев, когда белоснежные лепестки на ветвях напоминают пушистые снежные хлопья.

С востока и запада от дворца Петра I находятся цветники, планировка которых воссоздана по чертежам архитектора Ф. Б. Растрелли 40-х годов XVIII века. По периметру цветников высажены стриженые кусты барбариса. Согласно исторической традиции, ассортимент цветов представлен луковичными растениями, в первую очередь тюльпанами. В память о первом владельце Деревянного дворца, один из сортов тюльпанов, украшающих партеры, носит имя Петра I. Смена времен года всякий раз привносит в оформление цветников новизну: весна – яркость тюльпанов и нежность крокусов, легкий аромат нарциссов и вербены; лето – пора бегонии, совершенства лилий, торжественной красоты ирисов; осень – это разноцветная россыпь георгинов, хризантем и астр. Летом в огромных керамических вазах высаживаются теплолюбивые экзотические растения. Осенью их сменяют композиции из овощей, выращенных на возрожденном стрельнинском огороде. Моду на овощные и фруктовые горки в Россию привез Петр I, позаимствовав идею у французского короля. В наше время в Петергофе возродили красивую традицию – когда в Петровском огороде созревает урожай кабачков, патиссонов и тыкв, ими оформляют керамические вазы у дворца Петра I и в Нижнем парке – в саду "Монплезира", где они и находятся до первых холодов.

Родословная петра 1 схема

Родословная петра 1 схема
Родословное дерево царей, императоров и регентов династии. Генеалогическое древо царской семьи романовых риа.Петр i великий – биография, реформы, жены и дети, внешность.

Династия романовых: схема с датами правления.

§116 престолонаследие после петра i, екатерина i русская.
Династия рюриковичей схема родословной с датами.
Оригинал схема вышивки "петр 1" схемы автора "vikysha.
Династия романовых: генеалогическое древо семьи полностью с. Династия романовых российская империя история.

Хронологический список правителей руси.

Дети петра i — википедия.

Родословные схемы. Царские судьбы.

Родословная таблица русских государей | я русский.

Династия романовых (1613-1917 годы).

Семья петра i великого фото и биографии родственников.
Русские цари династии романовых династия романовых.
Династия романовых: правители, изменившие облик страны. Династия романовых: генеалогическое древо с годами.

Святой род русских царей. Интерактивное генеалогическое древо.

Глава вводная родословная дворян раевских::: раевский. Lenovo s415 touch драйвера Epub скачать старик и море Hp g2410 сканер драйвер Скачать музыку mp3 с вк Маршрутка скачать игру

Структура популяции и объединение в родословных: сравнение со структурированным объединением и основа для вывода

2.

1. Моделирование родословной

Если не указано иное, каждая рассматриваемая нами популяция имеет два дема постоянного размера, симметрично обменивающихся мигрантами с постоянной скоростью. Эта модель демонстрирует влияние структуры населения одним из простейших возможных способов. Согласно предположениям стандартной теории слияния, слияние в такой популяции двух демов описывается структурированной сливающейся (Notohara, 1990; Hudson, 1991) моделью, описывающей миграцию предковых линий между демами и слияние предковых линий внутри демов.Имея всего две демы и постоянную скорость миграции, эта модель имеет относительно простое математическое описание (Wakeley, 2009).

Мы предполагаем, что поколения не пересекаются и что в популяции есть лица двух полов в равном количестве. В каждом поколении каждая особь выбирает мать равномерно случайным образом из самок одной демы с вероятностью 1 - m и из самок другой демы с вероятностью m . Точно так же отец выбирается равномерно случайным образом из самцов одной демы с вероятностью 1 - m и из самцов другой демы с вероятностью m . Эта система воспроизводства соответствует воспроизводству путем широковещательного нереста, когда гаметы мигрируют, а особи - нет. Эта схема миграции поддерживает постоянный размер дема от поколения к поколению.

При отображении родословных на рисунках в этой статье мы не делаем различия между мужчинами и женщинами, поскольку ни один из наших результатов не зависит от пола людей. Нынешнее поколение, из которого всегда отбираются особи, изображено внизу родословной, причем две линии, идущие вверх, показывают материнские и отцовские отношения с предыдущим поколением.При наличии двух демов особи, населяющие ту или иную дему, окрашены в белый или серый цвет соответственно.

Все моделирование проводилось с использованием угольного пласта , программы для моделирования слияния на основе случайно сгенерированных родословных популяций. Пользователь предоставляет такие параметры, как размер популяции, количество демов, скорость мутаций и скорость миграции, а угольный пласт моделирует родословную популяции в соответствии с моделью Райта-Фишера, удовлетворяющей указанным условиям. Генные генеалогии строятся путем моделирования сегрегации в прошлом через родословную, а полученные в результате генеалогии используются для создания смоделированных генетических локусов.Выходные данные имеют формат, аналогичный формату программы ms (Hudson, 2002), и различные параметры позволяют пользователю моделировать и анализировать родословные, показывающие, например, недавние выборочные проверки или фиксированные количества недавнего родословного родства и происхождения мигрантов.

Программа Coalseam написана на языке C и выпущена под лицензией GPLv3. Он доступен в Интернете по адресу https://github.com/ammodramus/coalseam.

Рисунок 2:

Распределение времени слияния для независимо сегрегированных локусов, взятых у двух индивидуумов в панмиктической популяции.Серая линия показывает распределение по родословной, а черная линия показывает экспоненциальный прогноз стандартного слияния. Размер популяции N = 500 диплоидных особей.

2.2. Родословные структурированной популяции и вероятности слияния

Как описано в (Wakeley et al. , 2012), в хорошо перемешанной популяции размером N распределение времени слияния для независимо сегрегированных локусов, отобранных от двух особей, показывает большое колебания в течение первых ∼ log 2 ( N ) поколений в зависимости от степени совпадения родословных двух особей.После этого начального периода вероятности слияния быстро сходятся к ожидаемым согласно стандартной теории слияния с небольшими колебаниями вокруг этого ожидания (рис. 2, см. Также Wakeley et al. 2012). Величина этих колебаний зависит от размера популяции, но даже для популяций небольшого и среднего размера (например, N = 500) экспоненциальный прогноз стандартного слияния является хорошим приближением к истинному распределению после первого логарифма 2 ( N ) поколений.

В большой структурированной популяции из двух популяций с симметричной скоростью миграции м на поколение и размером диплоидной демы N процесс слияния описывается двухдемовым структурированным слиянием с масштабированной скоростью миграции M / 2 = 2 Нм на линию и степень слияния 1 для каждой пары линий в одной деме (Wakeley, 2009). Распределение времен парного слияния в рамках этой модели можно рассчитать, возведя в степень матрицу скоростей миграции и коалесценции, давая распределение времен слияния для двух хромосом, отобранных в одной и той же деме, и распределение времени слияния для двух хромосом, взятых из разных демов, где т - это , измеренное в единицах 2 N поколений и .Это прогнозируемые распределения времен попарного слияния в популяции с двумя демами с использованием стандартного подхода, который неявно предполагает маргинализацию по сравнению с родословными.

Когда родословная популяции с двумя демами фиксирована, вероятность слияния зависит от истории миграции, заложенной в родословной популяции. Отклонения от прогнозов структурированной коалесценции особенно заметны, когда среднее количество миграционных событий на поколение имеет тот же порядок, что и вероятность парного слияния пергенераций, т.е.е., Н · м ≈ 1 / N (рис. 3А). В этом режиме, ограниченном миграцией, две линии могут «застрять» в разных демах и иметь нулевую вероятность объединения до того, как миграционное событие в родословной сможет объединить их в одну дему. Это создает большие пики в распределении времени слияния для локусов, сегрегированных независимо по одной и той же родословной, причем каждый пик соответствует событию миграции (Fig. 3A).

Рисунок 3:

Распределение времени слияния для двух особей, взятых из разных демов.На обеих панелях черная линия показывает распределение, рассчитанное на основе одной случайной родословной, а фиолетовая линия показывает прогноз, полученный на основе структурированного слияния. Красные вертикальные линии вдоль горизонтальной оси показывают возникновение миграционных событий в популяции, при этом относительный рост представляет собой общий репродуктивный вес (см. Barton and Etheridge, 2011) мигранта (ей) в этом поколении. A) Низкая миграционная родословная, с M = 4 Nm = 0.04 и N = 100. В этих условиях слияние ограничено миграционными событиями, поэтому во временном распределении слияния есть отдельные пики, соответствующие отдельным миграционным событиям. B) Более высокая родословная миграции, с M = 0,4 и N = 1000. При более высокой скорости миграции слияние больше не ограничивается миграцией, но стохастические колебания в процессе миграции с течением времени вызывают отклонения от стандарта -коалесцентный прогноз на временной шкале, превышающей log 2 ( N ) поколений.

Даже когда скорость миграции выше и есть много событий миграции на одно событие слияния, родословная все равно может привести к тому, что вероятности слияния будут отличаться от прогнозов структурированного слияния. В этих условиях слияние не ограничивается отдельными миграционными событиями, но могут иметь место стохастические колебания реализованной скорости миграции, при этом в одни периоды миграция больше, а в другие - меньше. Эти флуктуации могут вызывать отклонения в прогнозируемых вероятностях слияния, значительно превышающие временную шкалу генерации log 2 ( N ), обнаруженную в хорошо перемешанных популяциях (рис. 3Б, S1, S2). Степень этих отклонений зависит от скорости миграции и размера популяции, при этом меньшие популяции и более низкие скорости миграции вызывают большие отклонения, а отклонения от прогнозов обычно больше для выборок, взятых между демами, чем выборок внутри демов. В целом, однако, когда происходит много миграционных событий на одно событие слияния (т.е. когда), предсказания структурированного слияния достаточно хорошо соответствуют наблюдаемому распределению в родословных (рис. S1 – S2).

Рисунок S1:

Распределение времени слияния в популяциях с двумя демами с N = 100 особей в каждой деме. На каждой панели показано распределение времени слияния для определенного значения скорости миграции. Для панелей в левом столбце была отобрана выборка двух особей из одной демы (выборка «внутри дема»), а в правом столбце - двух особей. разные демы.

Рисунок S2:

Распределение времени слияния в популяциях с двумя демами с N = 1000 особей в каждой деме.Каждая панель показывает распределение времени слияния для определенного значения скорости миграции. Для панелей в левом столбце были отобраны два человека из одной демы (выборка «внутри дема»), а в правом столбце - два человека из разных демов.

Чтобы более систематически исследовать зависимость распределения времени слияния от родословной, мы смоделировали 20 реплик родословных популяций с разными размерами демов и скоростью миграции. Из каждой родословной мы отобрали двух особей из разных демов и рассчитали распределение времен попарного слияния для независимо сегрегационных локусов, отобранных у этих двух особей.Мы измерили общее расстояние изменения этого распределения по распределению времен слияния, предсказанному в рамках двухдемовой модели Райта-Фишера с дискретным временем со скоростью миграции, равной скорости миграции, полученной при моделировании. Общее расстояние вариации двух дискретных распределений P и Q определяется как

Теоретически это бесконечная сумма, но на практике мы суммируем по поколениям (где - ожидаемое время слияния демов), помимо что в этих распределениях остается очень малая вероятность и, следовательно, очень небольшой дополнительный вклад в общее расстояние вариации. Мы обнаружили, что общее расстояние между распределениями по родословным и распределениями по стандартной теории увеличивается по мере уменьшения как размера популяции, так и скорости миграции (рис. 4A). Когда общая скорость миграции в масштабе популяции (т. Е. Nm ) больше, чем скорость слияния внутри демов (т. Е. Когда, или пунктирная линия на рис. 4B), общее расстояние вариации больше зависит от размера популяции. чем по скорости миграции. Когда общая скорость миграции меньше скорости слияния демов (), общее расстояние вариации значительно увеличивается и больше зависит от скорости миграции в масштабах всей популяции, чем от размера демов (рис.4Б). Это показывает, что родословная оказывает сильное влияние на слияние, когда среднее количество мигрантов на поколение, Nm , относительно мало по сравнению с вероятностью слияния на поколение в деме, 1 / (2 N ). В этом случае модели коалесценции плохо аппроксимируются типичной теорией коалесценции.

Рисунок 4:

Среднее общее расстояние вариации между распределениями времени слияния в родословных двух демов популяций и распределениями времени слияния, предсказанными в рамках двухдемовой модели Райта-Фишера. Для каждого диапазона скоростей миграции было смоделировано двадцать повторяющихся родословных, и для каждой родословной было рассчитано распределение времен слияния для случайно выбранной пары особей, а общее расстояние вариации было рассчитано из распределения, которое можно было бы спрогнозировать в соответствии с аналогичная двухдемная модель Райта-Фишера. Каждая линия показывает, как среднее значение этих общих расстояний варьирования зависит от скорости миграции. На панели A) показано общее расстояние отклонения от среднего числа миграционных событий на поколение Нм .На панели B) показано общее расстояние изменения в сравнении со средним числом событий миграции на событие слияния, N 2 м . Пунктирная линия показывает, где N 2 м = 1.

2.3. Недавняя родословная мигрантов и распределение слияния в родословных

Как и в случае панмиктических популяций, подробности родословной недавней выборки являются наиболее важными для определения паттернов генетической изменчивости в выборке. В панмиктических популяциях совпадение предков в недавнем прошлом увеличивает вероятность слияния в совсем недавнем прошлом, что приводит к возникновению идентичности по происхождению. В структурированных популяциях индивид также может иметь недавних родственников из другой демы. Когда это происходит, распределение времен попарного слияния потенциально сильно отличается от предсказанного в отсутствие недавних предков мигрантов из-за путей миграции в родословной, которые приводят к недавнему изменению демов. Степень различия в распределении напрямую связана с количеством предков мигрантов, причем более недавние миграционные события вызывают большее изменение распределения времени коалесценции (рис.5).

Рисунок 5:

Распределение времени попарного слияния для образцов с мигрантской родословной. На каждой панели показано распределение времен попарного слияния для пары особей с разной родословной выборки. В каждой моделируемой родословной популяции есть две демы размером N = 1000, а масштабируемая скорость миграции составляет 4 Nm = 0,1. В каждой панели родословная популяции моделировалась при условии, что образец имел родословную, показанную на панели. Фиолетовая линия показывает распределение времени слияния демов, которое можно было бы ожидать при отсутствии недавних предков мигрантов, а золотая линия показывает смесь распределений времени слияния внутри демов и между демами, которая соответствует степени происхождения мигрантов. .Черные линии представляют собой численно рассчитанные (т.е. точные) распределения времени слияния для смоделированных примеров родословных.

Если особь в выборке имеет событие миграции в своей недавней родословной, существует некоторая вероятность того, что копия гена, взятая в выборке от этого человека, была унаследована через родословную, включая это недавнее миграционное событие. В этом случае будет казаться, что эта копия гена была фактически взята из демы, отличной от той, из которой она была взята.Таким образом, недавняя родословная выборки «реконфигурирует» выборку, изменяя местоположение выбранных копий гена, с вероятностями различных реконфигураций выборки в зависимости от количества и времени миграционных событий в недавней родословной.

Если копии генов отбираются во многих независимо сегрегированных локусах от людей, имеющих мигрантное происхождение, образцы в некоторых локусах будут реконфигурированы в результате недавних миграционных событий, а другие - нет. В этом сценарии сам образец может быть смоделирован как вероятностная смесь образцов, взятых в различных конфигурациях, и вероятности слияния могут быть рассчитаны, рассматривая эту смесь.Например, рассмотрим выборку независимо разделяющихся локусов, взятых у двух индивидов, связанных родословной, показанной на рис. 5C, где у одного из двух индивидов, взятых в выборку из разных демов, есть дедушка или бабушка из другой демов. Распределение времен парного слияния для локусов, выбранных из этой пары, похоже на распределение, где T b - стандарт между временем попарного слияния демов для структурированно-коалесцентной модели с двумя демами, T w - это стандартное время парного слияния демов. что соответствует времени парного слияния демов, и X ∼ Бернулли (1 / 4) (рис. 5С). Эта конкретная смесь отражает тот факт, что линия, отобранная от индивида с мигрантской родословной, следует по пути миграции через родословную с вероятностью 1 / 4.

Эта структура реконфигурации образца также может использоваться для моделирования идентичности по происхождению IBD), вызванное очень недавним слиянием из-за перекрытия ветвей в родословной последней выборки. Если родословная вызывает событие IBD с вероятностью Pr (IBD), то время попарного слияния представляет собой смесь стандартного распределения (без IBD) и мгновенного слияния (на шкале времени слияния) с вероятностями 1 Pr (IBD) и Pr (IBD) соответственно.Если в родословной выборки есть как недавняя коанцестрия, так и недавняя миграция (или если есть несколько событий миграции или коанцестрии), выборку можно смоделировать как смесь нескольких реконфигураций выборки (например, рис.

Рис. 6:

Распределение времен попарного слияния для образца, родословная которого включает как недавнюю миграцию, так и недавнюю родословную коанцестрию. Показана недавняя родословная образца, при этом две отобранные особи расположены внизу родословной.Распределение смоделированной родословной (серая линия) рассчитано численно на основе родословной двух демов размером N = 1000 каждая, со скоростью миграции M = 4 Nm = 0,2. Цветные линии показывают смесь распределения времени слияния внутри демов ( f T w ) и распределения между демами ( f T b ). На вставке показана вероятность слияния в течение первых пяти поколений; вероятностная масса в поколении 1 (оранжевый кружок) предсказывается моделью смеси, учитывающей как недавнее происхождение, так и миграцию (оранжевая линия).Красная линия показывает распределение, если игнорируется недавнее происхождение, а синяя линия показывает распределение, если игнорируются и коанцестрия, и миграция.

Этот подход к моделированию выборки неявно предполагает, что существует некоторое пороговое поколение, разделяющее недавнюю родословную, которая определяет смесь реконфигураций выборки, и более древнюю родословную, где стандартные объединенные модели, как предполагается, достаточно хорошо работают. Естественная граница между этими двумя периодами составляет около 2 ( N ) поколений, поскольку любая родословная более древняя, чем указанная, имеет тенденцию разделяться большей частью или всем населением (что делает такие признаки «демографией населения»), тогда как любые более свежие функции с большей вероятностью будут относиться к образцу.

Отметим, что в популяционной генетике существует долгая история моделирования генетической изменчивости в родословных как смеси различных реконфигураций выборки. Райт (1951) писал о вероятности наблюдения гомозиготного A 1 A 1 генотипа как, где p - частота A 1 в популяции, а F - по существу вероятность ВЗК рассчитывается на основании выборки родословной. Это можно рассматривать как вероятность для смеси двух выборок размером n = 2 (с вероятностью 1 - F ) и n = 1 (с вероятностью F ). Популярная программа вывода предков STRUCTURE (Pritchard et al. , 2000) и родственные методы аналогичным образом записывают вероятность наблюдаемых генотипов как смесь различных возможных субпопуляционных источников выбранных аллелей. Здесь, мотивированные нашим моделированием слияния в родословных, мы явно расширяем этот подход на моделирование слияния. В следующем разделе мы предлагаем подход к определению параметров популяции, таких как частота мутаций и миграции, вместе с характеристиками родословной выборки, такими как недавнее происхождение и происхождение недавних мигрантов.В Обсуждении мы дополнительно рассматриваем сходства и различия между нашим подходом к выводам и существующими методами.

2.4. Совместный вывод недавней родословной выборки и демографии населения

Схема реконфигурации выборки для моделирования генетической изменчивости в родословных, описанная выше, может использоваться для расчета того, как недавние предки мигрантов перекрываются в оценках смещения родословных популяционно-генетических параметров. В Приложении A мы вычисляем смещение трех оценок скорости мутаций в масштабе популяции θ = 4 в панмиктической популяции, когда недавняя родословная выборки содержит недавно родственных или инбредных особей.В Приложении B мы вычисляем смещение оценки на основе моментов M из-за недавних миграционных событий в выборке родословной. Мы используем моделирование, чтобы подтвердить эти расчеты (рис. S3, S4). В обоих случаях, если известна родословная последней выборки, эти оценочные значения легко исправить, чтобы устранить систематическую ошибку.

Рисунок S3:

Оценки, основанные на 100 повторных симуляциях 200 локусов, сегрегированных по образцам родословных, с идентичностью по происхождению. Синие линии обозначают теоретические прогнозы для отдельных родословных и оценщиков.Красные горизонтальные линии обозначают выборочные средние по повторным симуляциям, а красные вертикальные линии обозначают удвоенную стандартную ошибку среднего. Истинное значение θ = 1. 0 показано пунктирной линией. Обратите внимание, что для первой родословной с n = 2 три оценщика эквивалентны.

Рисунок S4:

Оценки M на основе оценки, данной (17) в реплицируемых смоделированных наборах генетических данных из 100 локусов, сегрегированных по выборочным родословным, содержащим разное количество предков недавних мигрантов.Синие линии обозначают теоретические прогнозы для разных родословных. Истинное значение M = 0,2 показано пунктирной линией. P ( M ) указывает вероятность миграции в указанных родословных.

Однако недавняя родословная выборки известна редко, и, если она считается известной, она часто оценивается на основе тех же данных, которые используются для вывода демографических параметров. В идеале, можно было бы вывести долгосрочную демографическую историю вместе с конкретными особенностями выборки недавней родословной.В этом разделе мы разрабатываем подход максимального правдоподобия к выводу отношений в недавней выборке родословной и недавней родословной мигрантов вместе с долгосрочными масштабируемыми скоростями мутаций и миграции. В этом методе используется подход, предложенный в предыдущем разделе: родословная выборки определяет некоторый набор возможных результатов менделевской сегрегации в последних поколениях, а результирующая реконфигурированная выборка моделируется с помощью стандартного процесса объединения.

Мы моделируем популяцию с двумя демами размером N каждая, при этом каждая особь имеет вероятность m миграции в другую дему в каждом поколении.Мы изменяем масштаб времени на 2 N , чтобы скорость слияния в деме равнялась 1, а измененная скорость миграции на одну ветвь составляла M / 2 = 2 Nm . Мы предполагаем, что мы отобрали по две копии каждого локуса от каждого из n 1 (диплоидных) особей из демы 1 и n 2 особей из дема 2. Мы запишем общий размер диплоидной выборки как n 1 + n 2 = n , так что общее количество последовательностей, отобранных в каждом локусе, равно 2 n . Мы индексируем наши последовательности с помощью где i m и i p индексируем материнские и отцовские последовательности, взятые у индивидуума i . Это просто условные обозначения; мы не предполагаем, что эти обозначения матери и отца известны или соблюдаются.

Данные состоят из генетических последовательностей, отобранных в локусах L . Мы предполагаем, что существует свободная рекомбинация между локусами и отсутствие рекомбинации внутри локусов, и что мутация происходит в соответствии с моделью бесконечного множества сайтов.Мы также предполагаем, что предковый статус по сравнению с производным статусом каждого аллеля известен. При этих предположениях данные в локусе i , D i могут быть сохранены как двоичная матрица 2 n × S i , где S i - количество сегрегированных сайтов в locus и . В этой матрице первые две строки относятся к двум последовательностям, отобранным от индивидуума 1, вторые две строки - к последовательностям, отобранным от индивидуума 2, и так далее. Поскольку мы предполагаем, что не знаем, какие последовательности являются материнскими, а какие - отцовскими, две строки, относящиеся к отдельному человеку, располагаются в матрице произвольно.

Каждая недавняя родословная имеет некоторый набор возможных результатов сегрегации в недавнем прошлом, включая слияние линий (из-за недавнего родства родословных или инбридинга) и перемещения линий между демами (из-за недавних миграционных событий). Обозначен набор этих выборочных реконфигураций, и каждая реконфигурация представляет собой помеченный раздел с группами в каждом разделе, представляющими линии, которые выживают после сегрегации назад во времени через недавнюю родословную, и метки, указывающие местоположение (дема 1 или 2) линии передачи, представленной группой.В соответствии с каждой реконфигурацией выборки существует вероятность того, что эта реконфигурация выборки является результатом сегрегации назад во времени через недавнюю родословную.

Совместное правдоподобие θ , M и имеет форму

Вероятности умножаются для независимо сегрегированных локусов, поскольку их предки считаются независимыми после кондиционирования последней выборки родословной. Для расчета необходимо рассмотреть все способы наследования последовательностей D i по материнской и отцовской линии, поскольку мы предполагаем, что это неизвестно.Для последовательностей позвольте представить все 2 n возможных способов обозначения как материнского и отцовского. Каждая такая маркировка связывает каждую строку (или последовательность) с индексом в. Тогда у нас есть поскольку каждый способ наследования последовательностей имел место с одинаковой вероятностью. Здесь мы неявно предполагаем, что последовательности для каждого человека упорядочены (а не неупорядочены) в. Это не влияет на вывод.

Поскольку каждая реконфигурация представляет собой раздел I n , и каждая маркировка присваивает каждой последовательности a, не следует предполагать, что эти материнские и отцовские обозначения известны или соблюдаются.материнско-отцовская метка из вместе реконфигурации r и материнско-отцовской метки λ создает меченный демом раздел последовательностей, который мы обозначаем. Этот раздел представляет собой сросшиеся наследственные последовательности после разделения во времени по недавней родословной.

Каждый член суммы в (5) соответствует вероятности выборки для одного из этих разделов. Это

, где - набор неидентичных последовательностей в наборе последовательностей - индикаторная функция, а - стандартная вероятность выборки из бесконечного числа участков для последовательностей x , рассчитанная обычным способом без какой-либо ссылки на родословную.Эта вероятность выборки может быть рассчитана численно с использованием подхода динамического программирования (Griffiths and Tavaré, 1994; Wu, 2010, см. Ниже).

Приведенное выше уравнение говорит, что при условии, что определенные последовательности являются IBD (, т.е. , они находятся в одной группе в разделенных последовательностях), вероятность выборки является стандартной вероятностью бесконечности сайтов для набора последовательностей с удаленными повторяющимися последовательностями IBD. а также обозначения демов различных групп, соответствующие любым событиям миграции, которые могли произойти.Если какая-либо из последовательностей, обозначенных как IBD, на самом деле не идентична по последовательности, вероятность выборки для этой реконфигурации и материнско-отцовского мечения равна нулю. Это эквивалентно предположению, что в последней части родословной мутации не происходит.

Вместе (4), (5) и (6) дают общую совместную логарифмическую вероятность скорости мутации θ , скорость миграции M и последовательности с учетом родословной

Наша цель - максимизировать (7) более θ , M , и для оценки этих параметров.Самым прямым подходом было бы создание всех возможных недавних выборок родословных и максимизация логарифмической вероятности, обусловленной каждой родословной по очереди. Логично было бы рассмотреть все образцы родословных, восходящие к поколению ∼ log 2 ( N ), поскольку родословная родословная сходится в этой временной шкале (Chang, 1999; Rohde et al. , 2004), а это когда родословная больше всего влияет на вероятность сращивания. Однако при таком подходе количество рассматриваемых родословных было бы чрезмерно большим, и даже перечисление всех таких родословных было бы сложной проблемой (например,г., Steel and Hein, 2006). Даже если рассматривать только первые несколько поколений назад во времени, количество возможных выборочных родословных будет большим, а многие выборочные родословные будут содержать обширное совпадение или множество миграционных событий и, таким образом, вряд ли возникнут в природе. В большинстве популяций более вероятно, что у каждого человека в выборке будет мало совпадений или миграционных событий в нескольких самых последних поколениях, если таковые имеются.

Имея это в виду, мы ограничиваем набор возможных выборочных родословных только теми выборочными родословными, которые содержат два или меньше событий, с учетом как совпадений, так и миграционных событий.Мы также ограничиваем количество возможных выборочных родословных, рассматривая только первые четыре поколения назад во времени, считая нынешнее поколение первым поколением. Это меньше поколений, чем log 2 ( N ) поколений, пока родословная не сойдется, но увеличение максимального поколения увеличит количество возможных родословных до точки превышения вычислительных ресурсов. Однако, поскольку события в родословной имеют наибольшее влияние на оценки демографических параметров, когда они происходят недавно (рис.S3, S4), учитывая только самые последние поколения, устраняет самые большие источники систематической ошибки в демографических параметрах из-за родословной выборки.

Наконец, поскольку мы предполагаем, что мы не знаем родительского происхождения каждой последовательности, мы дополнительно уменьшаем количество возможных выборочных родословных, включая только родословные, которые являются уникальными, вплоть до обозначения предков как материнских и отцовских.

Чтобы сгенерировать все родословные выборки из двух демов, четырех поколений с двумя или меньшим количеством событий, мы сначала генерируем все возможные родословные из двух поколений, рассматривая все способы, которыми n особей (где n - размер диплоидной выборки) могут иметь родителей в двух разных демах, и затем из каждой из этих родословных двух поколений были получены родословные трех поколений, сделав то же самое, а затем родословные четырех поколений были произведены из родословных трех поколений. Распределение реконфигурации выборки для каждой родословной из четырех поколений было рассчитано путем перечисления всех возможных способов разделения родословных предков на разные предковые хромосомы в каждом предковом поколении, и каждое такое разбиение засчитывалось как состояние в разреженной матрице, содержащей состояние вероятностей перехода в разреженном состоянии. матрица, содержащая вероятности перехода (вычисленные по правилам менделевской сегрегации) от одного поколения к другому. Матрицы перехода от поколения к поколению были перемножены, чтобы получить окончательное распределение реконфигурации выборки.

Не каждая родословная в рассматриваемом наборе дает уникальное распределение реконфигураций выборки, поэтому в нашем методе вывода родословная не может быть строго идентифицирована. Таким образом, мы помещаем родословные в группы, которые производят одинаковое распределение реконфигураций выборки, и они принимаются как область родословных при заключении.

Чтобы вычислить стандартные вероятности выборки, необходимые в (6), мы используем метод динамического программирования, описанный Wu (2010). В принципе, должна быть возможность вычислить логарифмическую вероятность всех родословных одновременно, поскольку любая реконфигурация выборки посредством IBD или миграции должна соответствовать одной из наследственных конфигураций в рекурсии, решенной методом Wu (2010) (см. Также Griffiths и Таваре, 1994).Для конкретных значений θ и M после решения наследственной рекурсии только один раз (и сохранения вероятностей выборки всех соответствующих предковых конфигураций) вероятность любой родословной может быть вычислена путем извлечения соответствующих вероятностей из рекурсии. Однако, чтобы использовать этот подход для максимизации логарифма правдоподобия, необходимо решить рекурсию на большой сетке θ и M . На практике мы обнаруживаем, что быстрее максимизировать логарифмическую вероятность отдельно для каждой родословной, используя стандартные процедуры численной оптимизации без производных, чтобы найти M и θ , которые максимизируют логарифмическую вероятность для родословной.

Чтобы проверить наш метод вывода, мы смоделировали наборы данных выборок из 1000 независимо сегрегированных локусов, сгенерированных путем моделирования слияния через случайно сгенерированную родословную двухдемовой популяции с размером демов N = 1000 и одной из двух скоростей миграции, M ∈ {0.2, 2.0} Мы выбрали одну особь (две последовательности в каждом локусе) из каждой демы. Данные последовательности были получены с использованием угольного пласта с использованием одной из двух скоростей мутаций: θ / 2 = 0.5 (когда M = 0,2) или θ / 2 = 1,0 (когда M = 2,0). Чтобы исследовать влияние недавних миграционных событий на оценку θ и M , каждый повторный набор данных был обусловлен наличием одной из трех различных родословных выборок с разным количеством предков недавних мигрантов (см. Рис.7). Мы вычислили оценки максимального правдоподобия θ и M для каждой из 78 групп родословных, дающих отчетливые распределения реконфигурации. Мы сравнили оценки максимального правдоподобия с оценками, которые были бы получены с помощью аналогичной процедуры максимального правдоподобия, которая игнорирует родословную (, то есть , предполагая нулевую родословную при отсутствии реконфигурации выборки).

Рисунок 7:

Скорости мутаций с максимальной вероятностью и скорости миграции для наборов данных, смоделированных с помощью различных выборочных родословных. Каждая точка отображает оценки максимального правдоподобия θ и M для конкретного моделирования. Оранжевые точки показывают оценки, полученные, когда родословная включена в качестве свободного параметра, а фиолетовые точки показывают оценки, полученные, когда предполагается, что родословная не влияет на данные.В первых двух столбцах один из отобранных особей обусловлен наличием родственника из другой деми, а в третьем столбце данные генерируются из полностью случайных родословных. На каждой панели истинные значения параметров показаны сплошным белым кружком, а горизонтальные и вертикальные линии показывают средние значения по репликам. Серые линии соединяют оценки, рассчитанные на основе одного набора данных.

Когда в выборке присутствовали предки недавних мигрантов, предположение, что нулевая родословная является истинной родословной, привело к смещению в сторону завышенной оценки скорости миграции (рис.7), поскольку ранняя вероятность миграции по пути миграции должна компенсироваться увеличением скорости миграции. По этой причине переоценка скорости миграции была больше, когда степень происхождения недавних мигрантов была больше. Уровень мутаций в масштабе популяции также был переоценен, когда недавнее происхождение мигрантов в родословной игнорировалось, предположительно потому, что миграция по пути миграции не уменьшала аллельное разнообразие в такой степени, как должна была бы завышенная скорость миграции.Включение родословной в качестве бесплатного параметра в оценку исправило эти предубеждения. Оценки на основе моделирования выборок, лишенных каких-либо признаков в недавней родословной, дали приблизительно несмещенные оценки θ и M (рис. 7).

Родословная не была установлена ​​так надежно, как частота мутаций и миграции (рис. 8). Когда смоделированная родословная содержала недавнее миграционное событие, предполагаемая родословная была правильной (из 78 возможных родословных) примерно в 20–25% случаев.Для родословных без происхождения мигрантов и без родства правильная родословная определялась примерно в одной трети случаев. Большинство ошибок в оценке родословной связано с неправильной оценкой родства в выборке. Если интерес представляют только детали миграционной родословной, результаты будут намного лучше, с правильной миграционной родословной, предполагаемой в 50–100% случаев.

Рисунок 8:

Вывод образцов родословных. Для моделирования 1000 локусов с бесконечными узлами, с θ = 0.5 и M = 0,2 ( A ) или θ = 1,0 и M = 2,0 ( B ) показаны различные измерения точности и мощности вывода родословной. Родословные условных образцов показаны внизу рисунка. Синие столбцы показывают долю симуляций, в которых родословная максимального правдоподобия соответствовала истинной родословной. Фиолетовые столбцы показывают долю симуляций, в которых был сделан вывод, что отобранные особи имели правильное количество предков-мигрантов.Зеленые столбцы показывают долю имитаций, в которых истинная родословная была найдена в пределах приблизительно 95% доверительного набора родословных, а розовые столбцы показывают долю имитаций, в которых нулевая родословная отклоняется тестом отношения логарифмического правдоподобия.

В дополнение к вычислению родословной с максимальным правдоподобием можно построить набор родословных с приблизительной достоверностью 95%, используя тот факт, что максимум логарифмической правдоподобия составляет приблизительно х 2 распределенных, когда количество локусов большой.Эти наборы достоверности родословной содержали истинную родословную в 83–96% случаев, в зависимости от истинной родословной выборки, частоты мутаций и скорости миграции. Тест отношения логарифмического правдоподобия имеет почти идеальную возможность отклонить нулевую родословную для моделирования с меньшей скоростью миграции; для моделирования с большей скоростью миграции сила зависела от степени происхождения мигранта, при этом более недавняя родословная мигранта дает больше возможностей для отклонения нулевой родословной (рис. 8). Частота ошибок типа I для моделирования, в котором нулевая родословная является истинной родословной, была близка к α = 0.05.

Наконец, мы также смоделировали наборы данных из 1000 локусов, отобранных у лиц с полностью случайными родословными (т. Е. Отобранных без привязки к каким-либо миграционным событиям в недавней выборке родословных) в небольшой двухдемной популяции размером N = 50 per deme с одной из двух различных скоростей миграции,. То, была ли родословная включена в качестве свободного параметра, почти не повлияла на оценки θ и M (рис. 9). Однако в тех немногих случаях, когда выборочная родословная включала недавние миграционные события, оценки были смещены, когда выбранная родословная не рассматривалась как свободный параметр, и включение выборочной родословной в вывод исправило эту ошибку (рис. 9).

Рисунок 9:

Скорости мутаций с максимальной вероятностью и скорости миграции для наборов данных из 1000 локусов, выделенных с помощью случайных родословных, смоделированных в популяции с двумя демами с размером демы N = 50. Каждая точка отображает оценки максимального правдоподобия θ и M для конкретного моделирования. Оранжевые точки показывают оценки, полученные, когда родословная включена в качестве свободного параметра, а фиолетовые точки показывают оценки, полученные, когда предполагается, что родословная не влияет на данные.Истинные значения параметров показаны белыми кружками, а горизонтальные и вертикальные линии показывают средние значения по репликам. Серые линии соединяют оценки, рассчитанные на основе одного набора данных.

Список кровных животных - ПОБЕДИТЕЛЬ COLT BY BLUE DIAMOND, ПРАЙД ОФ ДУБАЙ, РОДОСЛОВНЫЙ РЕЙТИНГ "AAA". БОЛЬШАЯ ЛОШАДЬ С БОЛЬШОЙ РОДОСЛОВНОЙ.

ОБУЧЕНИЕ У ПИТЕРА МУДИ

PRIDE OF DUBAI Street Cry (Ire) Machiavellian Mr.Prospector
Helen Street Troy
Al Anood Danehill (США) Danzig
Eljazzi (Ирландия) LIMO 905 905 9050 9050 905 905 905 9010 Забил Сэр Тристрам (Ирэ) Сэр Айвор
Леди Жизель (Франция) Нуреев
Оденсия (Ирэ) Арази (США) Blushing 905 Секретариат

PRIDE OF DUBAI (AUS) (Bay 2012-Stud Aust.2016, Ир. 2017). 2 победы из 2, MRC Blue Diamond S., Gr.1. Ведущий производитель первого сезона в Aust. в 2019-20 гг. Отец 162 rnrs, 60 wnrs, inc. SW Telepatic Glances (Milan Premio Dormello, группа 2), Flying Visit, Saif, Star of Emaraaty, Bella Nipotina, Fancy Man, Zaffy's Pride, Easifar, Tanker, SP Achiever, Sirileo Miss, Street Dancer, Dubai Star, Maha, Mystique Сокол, Идеальный мир, Гордость Дженни и т. Д. Его старшее потомство - 3-летние.

1-я плотина

LIMONCINO (NZ), by Zabeel. Победитель на 2100 м, 2-й отборочный турнир ARC Dunstan Feeds. Сводная сестра Mango Daiquiri . Это ее шестой жеребенок. Плотина из 4 жеребят, участвующих в гонке, 2 победителя , inc: -

Misscino (f by Smart Missile) 4 победы с 1200 м до 1600 м, 135 730 австралийских долларов, до 2020-21, 2-й SAJC AAMI H.

Milady Cabriot (f by So You Think (Новая Зеландия)) 2 победы на 1300 м, 1400 м в Aust.

2-я плотина

AUDENCIA (IRE), Арази (США).Гонял один раз. Сводная сестра CHEROKEE ROSE (мать BOWMAN ), KELTOI , Volksraad , Congress (мать ROYAL INTRIGUE - ON SHAN BRAVE (HK) ), In Unison (мать SIRING) ЗАМОК КВЕСТ ). Плотина из 9 жеребят, 8 для гонки, 5 победителей , inc: -

Mango Daiquiri (f Cape Cross) 4 победы -1 на дистанции 2 - от 1400 до 2000 м, 193 600 австралийских долларов, MRC Skyy Blue P. , Arborea H., Австралийский музей гонок чемпионов MVRC H., 2d VRC Vili's H., MRC Courtza H., 3d VRC Wakeful S., Gr.2 , MVRC VJA 2YO H., 4th VRC Oaks, Gr.1 , VRC AV Kewney S., Gr.2 . Плотина из 4 победителей -

После (g Reset) 5 побед с 1850 до 2200 метров, 104 676 австралийских долларов, MVRC 2040club.com.au H., Sportingbet H., 2d Werribee Cup, L .

Родной язык. 4 победы на 1200 м, 1400 м, HKJC Kau - Shan H., Schnitzer H., Morse H., Wuxi H., 2d HKJC Fan Lau H., 3d HKJC Fuzhou H., Айленд Х., Руби Х., Сансет Пик Х.

Третья плотина

Селтик Ассамблея , Секретариат. Победитель на 10½f, 2d Goodwood Lupe S., L . Сестра SUBJECTIVE , сводная сестра MOLESNES , CELTIC HEIR , Bio Master , Be Yourself (мать SPIN AROUND - BETTER BOY (HK) ), Gardd (мать SCOUTING WIDE) . Плотина из 9 жеребят, 8 участвующих в гонке, 5 победителей , inc: -

CHEROKEE ROSE (f Dancing Brave) 5 побед -1 на дистанции от 2 до 1400 м, 72 160 фунтов стерлингов, 1355 000 франков. , Deauville Prix Maurice de Gheest, Gr.1 , Haydock Sprint Cup, Gr.1 , Longchamp Prix du Palais Royal, Gr.3 , Prix de la Porte Maillot, Gr.3 , 2-е место l'Abbaye de Longchamp, Gr.1 , Deauville Prix du Calvados, Gr.3 , 3d Longchamp Prix de Montretout, L , Saint-Cloud Prix Solitude, L , 4th Evry Prix Isola Bella, L . Плотина из 6 победителей -

BOWMAN (c Ирландская река) 4 победы с 1600 до 2200 метров, 22 910 фунтов стерлингов, 87 855 евро, 9 200 франков., 140 600 дирхамов в Великобритании, Франции и ОАЭ, Longchamp Prix de Fontainebleau, Gr.3 , Goodwood On the House S., L , Abu Dhabi Championship S., 3d Longchamp Poule d'Essai des Poulains, Gr. 1 , Jebel Ali Mile S., L .

Ahtoug (c Байроном) Чемпион Старшего Спринтера в Великобритании в 2014 году. 6 побед -2 на дистанции 2 на 1000 м в Великобритании и ОАЭ, Ascot Shergar Cup Dash, Честер Виктор Чендлер Х. , 2-й спринт Мейдана Аль-Куоз Gr.1 , Meydan Sprint S., Gr.3 - дважды.

Намек на весну. Победитель при 8¼f в ГБ. Плотина 4 победителей -

TULIPS (f Pivotal) 2 победы на 1400 м, 1600 м, € 115 885, Fontainebleau Prix Ceres, L , Chantilly Prix de la Remise des Lilas, 2d Deauville Prix de Meautry, .3 , Longchamp Prix du Palais-Royal, Gr.3 . Режиссер.

Moyesii. Победитель на 1700 м во Франции. Плотина из 7 победителей-

KIRKLEES (g Jade Robbery) Чемпион 2-летних Colt в Италии в 2006 году. 8 побед -2 на дистанции 2 - от 1400 м до 2400 м, 196 074 фунтов стерлингов, 147 840 евро, 75 000 австралийских долларов, 460 000 дирхамов в Великобритании, Италии и ОАЭ, Milan Gran Criterium, Gr.1 , York S., Gr.2 , Kempton September S., Gr.3 , Sandown Gala S., L , Goodwood Foundation S., L , Doncaster Crownhotel-Bawtry.com S., Nad al Sheba Xpress 2000 H. , 2d Newmarket James Seymour S., L , 3d Ascot Royal Lodge S., Gr.2 , Goodwood Vintage S., Gr.2 , Newmarket Darley S., Gr.3 , Nad al Sheba Al Rashidiya S., L , 4th York Champagne S., Gr.2 , Nad al Sheba Al Maktoum Challenge Round 3, Gr.2 .

MASTERY (c Sulamani) Чемпион 3-летнего стайера в Великобритании в 2009 г. и 3-летний чемпион Италии в 2009 г. (лонг). 5 побед -1 на дистанции 2 - от 1700 м до 2950 м, 381 159 фунтов стерлингов, 524 420 евро, 49 500 долларов США, 7 980 000 гонконгских долларов, 1 104 000 дирхамов, The St Leger, Gr.1 , Cathay Pacific Hong Kong Vase, Gr.1 , Rome Derby Italiano, Gr.2 , Kempton Floodlit S., L , 2d York Great Voltigeur S., Gr.2 , 3d Longchamp Grand Prix de Paris, Gr.1 , Royal Ascot Queen's Vase, Gr.3 , Newmarket Дарли С., Gr.3 , Breeders 'Cup Marathon S., L , Newmarket Houghton 2YO S. Отец.

Волшебное дерево. Гонял один раз. Плотина из 3 победителей -

MUKHADRAM (c Shamardal) 5 побед от 1 м до 10½ футов, 738 431 £, 30 000 евро, 7 340000 дирхамов, Sandown Eclipse S., Gr.1 , York S., Gr.2 , Sandown Brigadier Gerard S., Gr.3 , Newmarket Wood Ditton S., 2d Meydan Dubai World Cup, Gr.1 , Royal Ascot Prince of Wales's S., Gr.1 , Newmarket Portland Place Properties S., 3d Ascot King George VI & Queen Elizabeth S., Gr.1 , Sandown Eclipse S., Gr.1 , 4-й чемпион Ирландии в Леопардстауне S., Gr.1 , York International S., Gr.1 , Royal Ascot Prince of Wales's S., Gr.1 , Tercentenary S., Gr.3 . Сир.

Artisti. Unraced. Мать из 5 победителей -

MAGIC ARTIST (c Iffraaj) Чемпион по старшим лошадям Германии и Италии в 2015 году (Int.). 3 победы -1 на дистанциях 2 на 1300 м, 2000 м, 159 830 евро, 40 000 долларов США, 90 000 австралийских долларов в Италии и Германии, Milan Premio Ambrosiano, Gr. 3 , Munich Bavarian Classic, Gr.3 , 2d Rome Premio Presidente della Repubblica, Gr.1 , Baden-Baden Oettingen Rennen, Gr.2 , Zukunfts Rennen, Gr.3 , 3d Frankfurt Fruhjahrspreis des Bankhauses Metzler, Gr.3 .

Rose de France. Занял 3-е место во Франции. Плотина из 7 победителей -

(MISTER) SEA WOLF (g Amadeus Wolf) 12 побед -2 на дистанции 2 - от 1000 до 1600 метров, 20 371 фунтов стерлингов, 117 455 евро, 1406 350 австралийских долларов, до 2020-21 года в Великобритании, Ирландия и Aust, ATC Chelmsford S., Gr.2 , Shannon S., Gr.2 , Doncaster Prelude, Gr.3 , Winter Challenge H., L , 2d GCTC AD Hollindale S., Gr.2 , ATC Doncaster Prelude H., Gr.3 , Festival S., Gr.3 , Newcastle JC Newmarket H., Gr.3 , 3d ATC Canterbury S., Gr. 1 , Doncaster Prelude H., Gr.3 .

CABLE BAY (c Invincible Spirit) 3 победы -1 при 2-на 6f, 7f, 320 677 фунтов стерлингов, 5625 евро, Newmarket Challenge S. , Gr.2 , Haydock John of Gaunt S., Gr.3 , 2d Newmarket Dewhurst S., Gr.1 , Challenge S., Gr.2 , Goodwood Richmond S., Gr.2 , Newmarket Somerville Tattersall S., Gr.3 , 3d Ascot Summer Mile, Gr.2 , Doncaster Champagne S., Gr.2 , Curragh Gladness S., Gr.3 , 4th York Gimcrack S., Gr.2 . Сир.

INDIGO BALANCE - YULONG YUHENG (Aust.) (C Invincible Spirit) 3 победы -2 со 2 по 6 до 2021, Curragh S., L , Curragh Tally Ho Stud 2YO S., 4 Curragh Феникс С., Гр.1 .

Кара Белла. Занял 3-е место, 3-й Ньюмаркет. Сесил Бойд Рочфорт Х. Дамба из 7 победителей -

BELLO (g Exceed и Excel) 8 побед -2 на дистанции от 2 до 1500 м, 614 200 австралийских долларов, 1548 OR, 36 700 дирхамов, Ньюкасл JC Newmarket H., Gr.3 , ATC Rosebud 2YO Male Preview H., Джеки Макилрик Х., 2d ATC Tramway S., Gr.3 , Rosebud H., L , MRC Weekend Hussler S., L .

ЭМБЛЕМЫ (g Shamardal) 6 побед на 1150 м, 1200 м, 319 230 австралийских долларов, Gosford RC Takeover Target S., L , ATC Project Ten H., International Animal Health H., 3d Scone RC Luskin Star S., L .

TRENCHANT (g Medaglia d'Oro) 4 победы -2 на дистанции 2 - с 1300 до 1600 м, 213 960 австралийских долларов, до 2020-21, VRC Taj Rossi Series Final H., L , Bay & Ranges 2YO Х., 3d MVRC Друзья Эпворта 2 года Х., ATC Bowermans Furniture H.

KELTOI (c Soviet Star) 9 побед с 1600 до 2000 метров в Великобритании и ОАЭ, Jebel Ali S., L , Newbury Крукхэм С., 2-й Джебель Али С., L .

Volksraad (c Green Desert) 2 победы -1 на 2-at 6f, 7f, Ascot Clarence House S., Newmarket Red Lodge 2YO S., 3d Newmarket Challenge S., Gr.2 . Отец-чемпион.

Конгресс. Победитель на 2 ГБ. Плотина из 8 победителей -

ROYAL INTRIGUE - ON SHAN BRAVE (H. K.) (g Royal Applause) 4 победы -1 на 2 - от 1500 до 2000 м, Roscommon Lenebane S., L , HKJC Parkes H., 3d Leopardstown Eyrefield S., L , Tipperary El Gran Senor S., L .

Серра Негра. Победитель на 7¾f, 2d Sandown Bonusphoto H. Плотина из 6 победителей -

NOORDHOEK FLYER (c Pivotal) 4 победы на 1600 м, 1800 м, 1 274 500 рандов, Кенилворт Кейп Гинеас, Gr.1 , Грейвилл , KRA Guineas, Gr.2 , 2d Kenilworth Cape Derby, Gr.1 , Selangor Cup, Gr.2 , 4th Greyville Daily News 2000 S., Gr.1 . Сир.

Дальние холмы. Победитель на 1800 м, 3-й Дурбанвиль Спасибо за ваше покровительство H. Плотина из 3 победителей -

MOUNT LAUREL (f Ideal World) 4 победы на 1450 м, R324 875, в 2019-20, Turffontein Three Troikas S., Gr.3 , Мемориал Руди Арлара H., 3d Turffontein Johannesburg Spring Filly & Mare Challenge, Gr.2 .

Промесса. Победитель на 6f в ГБ. Плотина 4 победителей -

Duty Bound. Победитель на 1600 м, 2-й ATC Inglis H., BRC Skyracing.tv H. Плотина из 3 победителей -

RUBIRA (f Lope de Vega) Winner at 2, Counties RC Champagne S., L , 2d Роторуа ЖК Burton Construction H.

Конга. Unraced. Плотина 6 победителей -

CONTAT (c Diktat) 9 побед от 1200 до 1600 метров, 194 495 евро в Германии, Баден-Баден Беназет Реннен, Gr.3 , Cologne Silberne Peitsche, Gr.3 - дважды, 2d Baden-Baden Goldene Peitsche, Gr.2 , Cologne Silberne Peitsche, Gr.3 , 3d Hoppegarten Benazet Rennen, Gr.3 , Hamburg Jaxx Pokal, Gr.3 . Сир.

В унисон. Победитель на 1 м в Великобритании, 4-й Миланский Премио Альберто Занолетти ди Роццано, L . Плотина из 5 победителей -

SIRINGAS (f Barathea) 4 победы -1 на 2 на 1 м, 8½f, 32 351 £, 246 665 долларов США, Woodbine Nassau S. , Gr.3 , Leopardstown Brownstown Stud S. , L , Gulfstream Park Allowance, 2d Belmont Athenia H., Gr.3 , Monmouth Matchmaker H., Gr.3 , 4th Curragh Desmond S., Gr.3 . Режиссер.

CASTLE QUEST (Гранд Лодж) 3 победы -1 на 2-м 7-м, 1 м, Leopardstown Brownstown Stud S., L , Curragh Peter Byrne April Fillies 'H., Shelbourne 2YO Fillies S., 2d Curragh Desmond S., Gr.3 , Silver S., L . Режиссер.

Заметки о ранней родословной Сэвилла и дворецкие из Скелбрука и Кирк Сандал

Средневековая английская генеалогия: заметки о ранней родословной Сэвилла и дворецкие Скелбрука и Кирк Сандал

ЗАПИСИ К РАННЕМУ САВИЛЬСКОМУ РОДОСЛОВУ И БАТЛЕРЫ ИЗ СКЕЛБРУКА И САНДАЛА КИРКА.

[РАЗДЕЛ I]

[ Йоркширский археологический журнал , т. 28, pp. 380-419 (1926)
Электронный текст и дополнительные примечания любезно предоставлены Дэвидом Хепвортом
HTML-версия Криса Филлипса]

ПОЗДНИЙ У. ПЕЙЛИ БЕЙЛДОН, Ф.С.А.

ПРЕДВАРИТЕЛЬНАЯ ЗАПИСКА.

в т. xxv ​​этого журнала . мой отец рассказал о основная линия семьи Савилов. Ранее он имел дело с некоторыми младших ветвей, в том числе Сэвил Копли и Сэвил из Нью Холл, в его выпуске Посещение Дагдейла .Его интересы лежат по большей части в тот период нашей истории, свидетельства о котором предоставляется по завещаниям и приходским книгам; и он сделал не стремятся дать подробную информацию о семье Сэвилов до эры сэра Джона Сэвила, который женился на наследнице Эланд в середина четырнадцатого века. Но в ходе его расследований он был в тесном контакте с мистером Бейлдоном, который для многих лет собирал записи, в основном из Свитков о признании вины, с относительно происхождения и ранних поколений этого выдающегося Семья Йоркшир; и он надеялся, что г.Бейлдон в должным образом опубликуйте результаты его исследований в форме пролога в свою газету. Г-н Бейлдон обнаружил, что имеющаяся информация было намного больше, чем он первоначально ожидал; и связь с семьей Батлер представляла такой интерес, что оправдывала значительное дополнение к его оригинальной схеме. Но во время его смерть в 1924 году, он практически выполнил свою задачу, и Настоящая статья была почти готова к публикации в журнале Journal .Я помню, как он говорил мне, он только ждал возможности "прохождения списков присяжных в различных округах", хотя он не был оптимистичен в поиске какой-либо дополнительной информации по материалам значение; и похоже, что он все еще работал над одним или двумя пунктами возникшие из более поздних поколений родословной Батлера. Но статья настолько полна в ее нынешнем виде, что ее публикация, ожидается, что его не только будут приветствовать члены Общества, но предоставит дополнительный памятник г.Бейлдон непревзойденный возможности исследования.

Работа по редактированию была незначительной. Несколько ссылок на были добавлены печатные книги, оставленные без внимания мистером Бейлдоном; некоторые из его незакрепленных записей были вставлены в то место, для которого он

380

явно предназначенные им; и эскиз родословной, который сопровождает Раздел II составлен на основе его собственного незаконченного проекта. Любой сноски редакционного характера заключаются в квадратные скобки.

Мистер Бейлдон завещал Публичной библиотеке Брэдфорда свои обширная коллекция заметок о йоркширских семьях; и спасибо Общества причитаются руководству Библиотеки за их любезно предоставили этот документ для публикации.

ЧАРЛЬЗ ГЛИН.

РАЗДЕЛ I. - ВВЕДЕНИЕ.

Ранние поколения родословной Сэвиллов, как указано в книге Уотсона. Галифакс , родословные Фостера Йоркшир и другие места весьма ненадежный. Многие из названных лиц являются существами воображение, в то время как другие датированы ранее или позже или иным образом неуместны в обычной безрассудной манере елизаветинской родословной торговцы. Было бы напрасной тратой времени и места указывать на все очевидные ошибки; Упомяну только о двух, о других речь пойдет ниже.Шестое поколение - это «сэр Джон Сэвил из Танкерсли». и его сын, внук, правнук и праправнук, все Джоны описываются как «Танкерсли». Что касается Фактически, собственность Танкерсли не перешла к Сэвиллам до тех пор, пока брак последнего упомянутого Иоанна с Изабеллой, наследницей Томас де Элланд. Генри Сэвилл, как говорят, младший брат этого последнего Джона, как говорят, женился на Эллен Копли "около 1300 "; Эллен была еще ребенком после смерти отца в 1370 году, и ее муж был сыном Генри Сэвилла Торнхилла.

Часто, если не обычно, предполагалось, что имя был получен из Сэвилл-Холла в Додворте, и, соответственно, старые родословные начинаются с «сэра Джона Сэвила из Сэвил-холла».

Уитакер в своей лучшей манере ex cathedra делает заявление смело, но не приводя ни аргументов, ни доказательств в свою поддержку.

"Пройдя нежную традицию, что совершенно несовместимо. на основании английской этимологии, это семейство произошли от Савелли в Италии, достаточно сказать, что они родник из Сэвил-холла, в Додворте, недалеко от Барнсли, который дал имя им, а не они ему »( Loidis et Elmete , p.311).

Охотник, кажется, склонялся к этой точке зрения, хотя и не говорил об этом. так много слов.

"В этом городке [Додворт], примерно в полумиле к югу от главная вилла, Сэвил-холл, старинное наследственное поместье, лежащее возле северной ветви Голубя. Это поместье принадлежало правления Генриха III, Эдуарда I и Эдуарда II семье

381

имя Сэвил, о котором было следующее поучительное дело, среди свидетельств сэра Джерваса Катлера в Стейнборо " ( Южный Йоркшир , т.2, стр. 260). Далее следует грант «Сейвиль». Зал », сделанный в 1311 году Томасом, сыном Болдуина де Сэвилля (см. Ниже). Я не могу согласиться с этой точкой зрения. Сэвилл-холл, я считаю, это имя, данное в дом его строители. Эта практика не была распространена в на севере, тогда как на юге очень много мелких субинфицированных усадьбы носили имена владельцев 1 ; но даже в Йоркшире есть несколько безошибочных примеров, таких как Торнхилл-холл в Уот-апон-Дерн, Ласеллс-холл в Лептоне, Турнхэме или Тернхэме Холл в Клиффе, недалеко от Селби, и, без сомнения, другие.

Более того, Сэвилл-холл, по-видимому, никогда не принадлежал главному линия семьи. Первое упоминание о нем, поскольку есть доказательства известно, содержится в только что упомянутом гранте, и Томас де Савиль кто предоставил это, был сын и, возможно, наследник Болдуина де Сэвилл, младший сын. Если бы он когда-либо был главным местом main, мы должны ожидать найти упоминания о нем ранее.

Серия возвратов, известная как Testa de Nevill , под датой 1242-3 (новая редакция), есть запись, которая на первый взгляд предполагает что на плато Лейси было какое-то место или поместье под названием «Сейвилл»; читаем "Seyvill, tercia pars unius militis" (Часть II, с.1103). В смежные записи, однако, являются именами человек , а не мест ; Ричард Фолиот предшествует, а Болдуин Тевтоникус следует за ним, что предполагает, что христианское имя было опущено. Г-н Фаррер соответственно печатает запись таким образом: "[- de] Seyvill" ( Early Yorks. Устав , т. 3, стр. 401), и он, безусловно, прав.

Нет никаких следов деревень, деревушек или имений под названием Савиль или все, что могло бы стать Сэвиллом, в Йоркшире или в любом другом другой округ, который можно найти в любом раннем документе, и форма имя явно французское.Теория о связи с римской семьей Савелли не имеет ничего, кроме сходства имени, чтобы поддержать его. Вряд ли можно сомневаться в том, что Савиль поселился в Англии при Генрихе II, как и многие французы. семьи сделали, и Куртенэ был ярким примером.

Заявление

Watson по этому поводу выглядит следующим образом:

"Другие полагают, что они пришли с Джеффри Плантаджине, потому что есть два города с этим названием на границах Анжу, оба были присоединены к короне Англии, когда сказал Джеффри женился на Мод, дочери и наследнице Генриха I " ( Галифакс , стр.209).

1 Шашечный суд может быть примером, о котором мы много слышали в последнее время.

382

Это заявление часто копировали, но без каких-либо дополнительная информация о местонахождении этих «двух городов». Во Франции есть несколько городов и деревень, имеющих названия приближается к Сэвиллу. Официальный Dictionnaire des Postes et des В Télégraphes есть пять мест под названием Савель, одно Савиль, два Совиля, один Савилли, один Севель, один Севиль и один Севилли. Большинство из них слишком далеки от сферы англо-нормандского влияния, и Насколько я знаю, нет никаких указаний на то, кто из других Савиллы берут свое имя. Возможно, наиболее вероятными являются (1) две деревни: Bas и Haut Sévielle , департамент Сены et Marne ; (2) La Sevelle , в департаменте Eure , но против это факт, что семья никогда не называлась de la Saville; (3) Севилли , в департаменте Орн ; и (4) Sauville , в Департамент Арденны .№№ 1 или 3 кажутся мне наиболее вероятными.

Судя по всему, все документы, относящиеся к первоначальной семейной собственности потеряны или уничтожены; во всяком случае их теперь нельзя найти, как любезно сообщил мне мистер Липскомб, агент лорда Сэвила. Те, которые напечатаны в томах Yorkshire Deeds, выпущенных в Рекордные серии относятся к собственности, приобретенной позже, например, в Смитон. Это большое несчастье и серьезнейший недостаток. К счастью, в тринадцатого века, записи о котором были помощь.

Одна из главных трудностей заключается в отсутствии какой-либо даты рождение, с помощью которого мы можем испытать поколения как вверх, так и вниз. Ранние Савиллы не владели главными землями, и, следовательно, нет никаких инквизиций, чтобы определить возраст наследника; такой документ в конец тринадцатого или начало четырнадцатого века были бы бесценный. Единственная доступная инквизиция, это Питер де Савиль. в 1286 году, это не post mortem , хотя ранее он был включен в эта серия, как и инквизиции ad quod damnum ; это было в природе de lunatico inquirendo , и поэтому Наследника нет, но в приказе упоминаются жена и дети, и мы можем сделать некоторые полезные выводы относительно возраста Петра.Во-первых, у него был живой дядя, Уильям Сэвилл; так что Петр не мог быть очень старым человеком. Мы увидим вскоре от Петра остались вдова, а также сын и наследник Иоанн, который был совершеннолетним около 1301 года или ранее. Если бы этот Иоанн был совершеннолетним в 1286 г. , когда было проведено расследование психического состояния его отца, мы могли бы разумно ожидать, что он был бы назначен по крайней мере, совместный опекун личности и имущества своего отца. Поскольку он не был назначен таким образом, справедливо предположить, что он находился под

383

возраст, так как он точно родился не позднее 1280 года.Если мы предположим 1275 год для приблизительной даты рождения Иоанна, мы увидим, что это превосходно вписывается в родословную, как по высоте, так и по низу.

Думаю, нет никаких сомнений в том, что именно Джон Сэвилл женился на Марджери де Ришворт, и мы можем проверить предложенную дату выше, рассматривая некоторые даты Ришворта. Марджери была одной трех дочерей и наследниц Генри де Ришворта, который все были женаты до 1306 года, когда умер сам Генрих. Он был, что касается части его земель, арендатором поместья Уэйкфилд, и его имя часто встречается в судебных списках.Раннее дошедшая до нас дата - 1275 год, последняя - 1298 год; его вдова, Алиса, происходит in 1307 ( Wakefield Court Rolls , Record Series. , vol. 1, p. 108; vol. 2, С. 48, 88). Он явно был в возрасте 1275 года, что дает 1250 лет. примерная дата его рождения. Три дочери, которые выжили его (могли быть и другие дети, которые умерли молодыми) поэтому, вероятно, родились между 1270 и 1275 годами или около того. Прибыв таким образом, правда, не на основании свидетельств, а на основании справедливый вывод и дедукция, что Джон, сын Питера Сэвилла и его обе жены родились где-то около 1275 года, я использовал это приблизительное дата в проверке поколений, как вверх, так и вниз, и то, что следует далее, помимо фактических доказательств, в основном основано на это предположение.

Чартеры Сэвилла и Батлера напечатаны в карте Pontefract пролил новый и неожиданный свет на раннюю родословную Сэвилла; тот факт, что отца Ришара де Савиля звали Хью Дворецкий ( Pincerna ), мягко говоря, сбивал с толку. и явно требовал тщательного расследования. Это я предпринял по просьбе покойного г-на Дж. У. Клея, F.S.A., в качестве введения к своей статье о семье Сэвилл, которую он готовил к Yorkshire Archological Journal (впоследствии напечатанный в т. XXV), но я чувствовал, что тщательное расследование ранних штрафов, Assize Роллы и другие записи были необходимы до того, как результат может быть достигнут, и удаление этих документов из Лондон во время войны задержал мои исследования. Отсутствие каких-либо семейные дела значительно усложняют достижение удовлетворительного вывод, а в родословной есть несколько пунктов которые, возможно, придется изменить, если должны быть обнаружены дополнительные доказательства.

Однако результат, хотя до некоторой степени неубедительный, позволяет нам впервые представить родословную, подтвержденную документальными фильмами. свидетельство.

Документы Понтефракта почти все недатированы, и

384

несколько исключений не устанавливают взаимосвязь между различными В них упоминаются Савиллы и Дворецки. Чтобы расположить их в примерный хронологический порядок и привязка лиц то, чем мы занимаемся, является большим трудом, и я вполне осознают, что другие могут прийти к другим выводам из следующих; Я привел свои доводы по всем материалам точки. Я не могу согласиться с выводами покойного мистера Холмса. что касается дат и отождествлений во многих случаях; эти, я думаю, все указаны.

Основная трудность состоит в том, чтобы уладить взаимосвязь между Савиллы и дворецкие, и решить, будут ли более поздние Савиллы произошли от Ришара де Савиля, который сообщает нам, что его отцом был Хью Батлер.

Два самых ранних Сэвилла, упомянутых в карте Понтефракта Ральф и Генри.

Я согласен с мистером Холмсом в том, что Ральф и Анри де Савиль были, вероятно, братьями (Record Series, vol. 30, p. 401), хотя я не согласны с тем, что Авис де Савиль, жена Хью Пинсерны, была их сестра, ни с предложением, сделанным в другом месте ( там же ., стр. 411) что она их кузина. '

Я не нахожу никаких следов их отца или каких-либо более ранних предков. Когда они попали в Йоркшир, как и почему и откуда они их фамилии, проблемы, в отношении которых, в отсутствие доказательств, мы можем только догадываться.

Одно преднамеренное изобретение (так я считаю) должно быть заметили, прежде чем мы начнем документальное свидетельство. Хроника приписывается Джону Бромптону, аббату из Джерволкса, напечатано Твисден в 1752 году утверждает (стр. 1158), что Ричард де Савиль был одним из семнадцать баронов на коронации Ричарда I в Вестминстере в Сентябрь 1189 года. Даже если допустить, что Ричард был иначе неназванным отцом Ральфа и Генри (см. ниже), в лучшем случае он был маленьким деревенским помещиком и, конечно, не имел права присутствовать на коронации или стать бароном.Сэр Т. Д. Харди утверждает, что хроника Бромптона должна была быть составлена ​​после середина четырнадцатого века. Национальный словарь В биографии говорится, что «работа полностью некритична, и, будучи широко признанный авторитетными писателями прошлого, был средства внесения множества басен в нашу историю ». Не сомневаюсь, что барон Ричард де Савиль - одна из басен.

385
Продам

беспородных собак

Разместите бесплатное объявление в различных категориях, таких как мобильные телефоны, планшеты, автомобили, велосипеды, ноутбуки, электроника, птицы, дома, мебель, одежда, платья для продажи в Пакистане. Списки породистых собак. Породные и беспородные щенки Здесь, в Nutshaw Kennels, мы имеем давнюю репутацию в разведении и продаже породистых и беспородных щенков домашних питомцев, которые хорошо размножены, здоровы, социализированы и счастливы. Приколи это. Порода собак Беспородные собаки. $, Все права защищены и охраняются законом. Найдите более 130 000 собак и щенков на продажу. Проверьте это! Хотя моя программа разведения сконцентрирована на родословной и выставках; первая и главная цель - темперамент.Продолжая, вы соглашаетесь с нашим Официальным уведомлением и подтверждаете, как мы обрабатываем ваши персональные данные и устанавливаем файлы cookie, как описано в нашей Политике конфиденциальности, О NewsNow Объявления ∙ Руководство по безопасным покупкам ∙ Ваша реклама здесь, Домашняя страница Newsnow ∙ О нас ∙ Реклама ∙ Пресса ∙ Контакты Мы ∙ Карьера, © Copyright 1997-2020 NewsNow Publishing Limited. Кобель, возраст Часто бывает трудно или невозможно определить, к какой смеси принадлежит собака. Calleigh Jack Russells - небольшой питомник, расположенный недалеко от Санбери, наши валеты - большая часть нашей семьи. На продажу выставлен щенок йорки возрастом более двух месяцев. Три девочки и один мальчик. Не родословная для продажи в Пакистане. Мама миниатюрного размера, а отец - йоркширский терьер размером с чайную чашку. Если вам понравился кот или собака из другой страны, профессиональные курьеры помогут вам доставить их в ваш регион. OLX Пакистан предлагает в Интернете местные объявления о собаках.Породистая собака измельченный корм 13,2 унции Ужин с курицей и рисом Консервы с влажным домашним животным 4 банка Мама и папа зарегистрированы как kc, имеют русские кровные линии и являются нашими ... У нас есть 4 очаровательных полнопородных щенка померанского шпица (доступно 3) некоторых редких окрасов. Щенок лабрадора 30 000 рупий от высокопородных родителей. Детям почти 2 месяца. Продам Беспородных собак в городе Москва, РФ. Навигация. «Беспородные щенки» - Dogs & Puppies, Rehome Buy and Sell в Великобритании и Ирландии Мы нашли для вас 93 объявления о «беспородных щенках» в разделе «Собаки и щенки» в Великобритании и Ирландии. Перейти к первому элементу результатов поиска Follow этот поиск Популярные запросы:... New Cl A ssifie d £ 1,350 Продаются Породные щенки шихтцу. Доступны черно-подпалые, красно-белые трехцветные щенки. Выращенные в семейном доме вокруг маленьких детей и других… Подробнее Мы нашли 94 «беспородных щенка» на продажу для вас в разделе «Собаки и щенки» в Великобритании и Ирландии Перейдите к первому элементу результатов поиска. Следуйте этому запросу. Популярные запросы: кокер-спаниель; кокапу; бордер-колли; такса; золотистый ретривер; Перейдите к параметрам уточнения поиска. Сортировать результаты по. 2 месяца 10 дней.gordanaz 14:40 17 дек 2020 Республика Сербия. "Породные собаки" - Местные объявления, для продажи в Великобритании и Ирландии Мы нашли 374 объявления о продаже "породистых собак" для вас в Великобритании и Ирландии. Перейдите к первому результату поиска. Следуйте этому поиску. от. Породная собака имеет двух родителей одной породы, и их генеалогическое древо (их родословная) записывается регистрирующим органом, например Клубом собаководства. Продаются чистокровные щенки от зарегистрированных заводчиков из Австралии и Новой Зеландии. Основным преимуществом породистой собаки является ее предсказуемость, поскольку отдельные собаки этой породы будут иметь схожие характеристики, такие как… 2 месяца 10 дней, продавец:… Продается прекрасный помет лабрадоров 9 осталось из помета 10.И это оживляет… Собаки-спасатели; Спасательные кошки; Кроликов-спасателей; Спасение рептилий; Спасайте мелких пушистиков; Спасательные птицы; Продажа собак. меню Разместить объявление; Поиск на Gumtree.com; Сообщения 1; Войти / Зарегистрироваться Искать в местоположении: Введите местоположение, чтобы увидеть результаты рядом. Выполнить поиск Go Популярные запросы: ... Породные щенки кане корсо на продажу Дарлингтон, графство Дарем Идеальное дополнение к вашей семье в 2021 году. Чтобы отправить домашнее животное за границу, вы Необходимо подготовить его заранее, а именно: Выберите своего идеального питомца, размывая линии, с «Petglobals».com ", Цена: Беспородные собаки, Недостатки кобеля / суки. ... Продается миниатюрный щенок Джека Рассела. Подросшая собака на продажу: взрослый бигль с отличной родословной KCI, доступный для продажи: чемпион Индии, сука английского пойнтера. Доступный для продажи: собаки, доступные в племенном заводе. Щелкните здесь, чтобы просмотреть и рекламировать ... Мальтийские щенки (игрушечная порода) Линька, обладание впечатляющей родословной, зарегистрировано в KCI, доступно для ухода за домами: щенки золотистого ретривера, отличные выставочные щенки, отличные… Собака на продажу Описание Порода Пол Расположение Посмотреть объявление; Шоколадные щенки кокер-спаниеля: выставлены на продажу 4 великолепных щенка кокер-спаниеля.Частное объявление, Age Mum - наш олененок из племенного клуба Pug, очень мягкий по натуре.мальчики. 20000 рупий без родословной. собаки Продаются непородные котята. Продаются беспородные котята. 2007г. Продаются беспородные котята в графстве Беркшир, грубый ливр, BSH идет осторожно, cest lhomme. 5 * Все зарезервировано * Kc Reg Show Gold Cocker. Наш уникальный алгоритм ценообразования классифицирует автомобили в соответствии с широким спектром факторов, оценивает рыночную цену для данной спецификации автомобиля и отображает этот ценовой тег при наличии достаточных данных (но не может учитывать причину продажи продавца, модификации автомобиля или условие).Этот раздел больше посвящен самой сделке, чем собаке или предмету: в этом разделе следует говорить о цене, условиях продажи, оплате, возврате собак, будущей вязке и т. Д. Собаки на продажу. Они также являются 22-м по популярности типом собак в Великобритании в целом, а также третьим по популярности беспородным типом собак. en.petglobals.com Это объявление размещено в городе Флакстон, штат Йорк, и его окрестностях. Породные группы собак. Калли Джек Расселс - Заводчик Джека Рассела, Виктория. Если вы ищете щенка, вы можете воспользоваться нашей услугой «Найти щенка», чтобы найти щенков на продажу.Купите, продайте и усыновите собаку, щенка, котенка и кошку на сайте PetsForHomes Australia. Щенки невероятные. Заводчик щенков, почему низкая цена и состояние здоровья. Поиск по ключевым словам. Наш уникальный алгоритм классифицирует вакансии по широкому кругу факторов, оценивает рыночную ставку для этой спецификации вакансии и отображает расчетную ставку оплаты, когда доступно достаточно данных (но не может учитывать различия в уровне необходимого опыта, обязанности или рабочее время), Продаются щенки King charles cavalier UK.Ожидается подписание контракта! (Кредиты: flickr) Детали транзакции. Благодаря этому мои собаки становятся частью моей семьи. Это цена, которую вы можете ожидать в бюджете на бордер-колли с документами, но без прав на разведение и без выставочного качества. Чтобы инкрустировать подмышечную юбку или внимательно _фигура_ котят, не являющихся родоначальниками, выставленных на продажу в эссексе лимбических каналов, плевроталли, не следует мыть вручную левулозу расположенного козла.Кавапу - результат скрещивания кавалер-кинг-чарльз-спаниеля с пуделем - обычно миниатюрным пуделем. Продажа щенков; Продажа лабрадоров; Кокер… (Некоторые щенки в помете будут иметь более гладкую шерсть… Изучите 851 объявление о продаже щенков непородных собак по самым выгодным ценам. Папа - редкий мопс плюшевого мишки Мерле в шоколаде и кремовых тонах. на продажу, наши щенки полны любви и привлекательности.Бесплатные объявления об охотничьих собаках для охотников на горных птиц и водно-болотных птиц. Мама и папа зарегистрированы как kc, имеют русские кровные линии и являются нашими ... Готовы с 24 декабря - Привет, у меня есть 1 красивый щенок ши-тцу, выставленный на продажу, который будет готов к его новому любящему дому в канун Рождества. New Cl A ssifie d £ 1,850 На продажу Прекрасные породные щенки ши-тцу. ... Породные щенки французского бульдога на продажу 2 мальчика левый полу-тигровый и полу-белый £ 1800 палевый пестрый £ 1800 щенки поступят в питомник, зарегистрированный в клубе и со страховкой щенка первые инъекции микрочипами ветеринара… 2 желтые суки 2 желтых кобеля 3 черных суки 2 черных кобели Мама - домашнее животное. .. Будьте в курсе о продаже щенков непородных собак. Добро пожаловать в Pedigree Gundogs. На самом деле, у нас есть множество заводчиков собак со взрослыми собаками, которым тоже нужен любящий дом. 3 девочки ... Наш милый лисий рыжий лабрадор, семейный питомец янтарный, дал начало потрясающему помету настоящих темно-красных лабрадоров. Мама где-то по колено умная и грациозная, а дети добрые, активные, веселые. Схема жилищного строительства Formanites, Лахор сегодня. Некоторых людей интересует очень конкретная порода собаки, кошки, щенка или котенка, и они думают, что единственный способ найти эту конкретную породу - это купить собаку на продажу или купить кошку на продажу ... Отфильтруйте свой поиск, чтобы найти породу, которую вы ищите в том месте, где вы ищете.Если вы вдруг подумали о собаке, приходите знакомиться. OLX Пакистан предлагает в Интернете местные объявления о собаках. Наша цель - разведение по темпераменту, типу и качеству. Щенки пуделя готовы к работе. Calleigh Jack Russells - небольшой питомник, расположенный недалеко от Санбери, наши валеты - большая часть нашей семьи. Продажа беспородных котят. Хинкли, Хинкли и Босуорт, Лестершир | 24 дек 2020 г. (2 дня назад) | Собаки на продажу от Лизы Макнейл. Щенки невероятные. Мы свяжем вас с заводчиками напрямую.∙ Политика конфиденциальности ∙ Официальное уведомление. Женщина, родилась 16.10.2020 Номер микрочипа 972274001376491 Полностью вакцинирована и проверена ветеринаром. Очень мило и ласково. Цены варьируются в зависимости от щенка, пожалуйста, прочтите описание: наши щенки прибыли 3 красавицы на одной из фотографий в объявлении изображена одна из наших последних сук WH NW ... Продается красивая полная родословная ши-тцу: мальчик - (продана) девочка - 1750 фунтов стерлингов (темно-коричневый и белый) девочка - 1750 фунтов (светло-коричневый и белый) родилась и выросла в ... У нас есть 7 красивых породных щенков французского бульдога редкого окраса из помета 9 человек.Этот сайт использует файлы cookie, чтобы обеспечить вам удобство использования. Часто бывает трудно или невозможно определить, к какой смеси принадлежит собака. Очень мило и ласково. Продаются щенки корги 4 мальчика и 3 девочки. Это затрудняет прогноз общего поведения, размера и внешнего вида щенка во взрослом возрасте. Карачи, Синд сегодня. Доля. Найдите родословных щенков на Gumtree, сайте №1 по продаже объявлений о продаже собак и щенков в Великобритании. Мужчина / Женщина Мужчина. 2 изображения. В продаже имеются очень симпатичные щенки с отличной родословной. Щенки среднеазиатской овчарки.Pets4Homes нашла на продажу в Ливерпуле 1168 собак и щенков, которые соответствуют вашим критериям. Платформа «Pedigree Gundog» была разработана с нуля людьми, которые активно работают в индустрии служебных собак. Платформа «Pedigree Gundog» была разработана с нуля людьми, которые активно работают в индустрии служебных собак. 3 месяца назад; Продается; Кошки; Смешанная порода; Уокинг. Отлично подходит для детей и других домашних животных. Калли Джек Расселс - Заводчик Джека Рассела, Виктория.Найдите собак, щенков, кошек, самый популярный сайт рекламы домашних животных для породистых и беспородных собак, щенков, кошек, котят и других домашних животных. 10 лучших пород собак. Продается племенная заводская сука ротвейлера в размере 60 000 рупий. Разведение собак Лицензия на ведение животноводческой деятельности требуется всем, у кого есть питомник (включая частные жилища) для собак, который отвечает следующим условиям: Эта платформа предоставляет вам всю необходимую информацию о щенках, их родителях и заводчиках. Породная собака рождается от двух собак одной породы и зарегистрирована в признанном клубе или обществе, которое ведет реестр собак этого описания.… Продается родословная в Пакистане. PetGlobals рекомендует использовать встроенный чат для быстрого общения! Продажа | Собаки | Смешанные породы | Ливерпуль. Посмотрите, сколько продаются щенки бордер-колли, ниже. Самое дешевое предложение начинается от 100 фунтов стерлингов. Белая, желтая рвота у собаки: причины, лечение, Крипторхизм у кошек: лечение, операция, последствия. Возраст 11 месяцев 23 дня. Результаты поиска - 1 - 15 из 1122. ru.petglobals.com Эти прекрасные щенки дахтцу будут готовы к своему вечному дому со 2 по январь. Мы работаем с уважаемыми заводчиками собак по всей территории Соединенных Штатов, чтобы создать надежную… Результат оказался успешным, поскольку щенки унаследовали гены от пуделя, которые придают кудрявой непроливающей шерсти поддающийся дрессировке любящий характер… Длинношерстный щенок-сука Найти родословную щенки на Gumtree, сайте №1 по продаже объявлений о продаже собак и щенков в Великобритании. Все права защищены и охраняются законом. Поиск по Craigslist, Craigslist больше не поддерживается Найдите кошек для продажи в Лас-Вегасе по объявлениям oodle.Продажа щенков от зарегистрированных заводчиков собак в Виктории, Австралия. Цель породы - получить щенка с кудрявой или волнистой, низкой или идеально не линяющей шерстью. Лучшая причина для того, чтобы завести собаку-помесь, заключается в том, что большинство собак в приютах для животных не имеют родословной, и важно, чтобы они нашли дом. Родословная чемпиона мира Непородные щенки немецкой овчарки в DHA, Лахор, Пакистан. Расположение - Ибадан. Домашние короткошерстные кошки, сервалы, бенгальские котята, сиамские кошки в лас-вегасе, шт.Продажа милых собак и щенков В VIP Puppies мы упрощаем вам поиск милых собак и щенков для продажи в Интернете. Это бесплатно. Самое дешевое предложение начинается от 100 фунтов стерлингов. Нажимая «ОК» или продолжая использовать этот сайт, вы соглашаетесь с тем, что мы можем собирать и использовать ваши личные данные и устанавливать файлы cookie для улучшения вашего опыта и настройки рекламы. 2000. Разместите бесплатное объявление в различных категориях, таких как мобильные телефоны, планшеты, автомобили, велосипеды, ноутбуки, электроника, птицы, дома, мебель, одежда, платья для продажи в Пакистане.Цена за 1850 фунтов стерлингов на продажу продается за менее чем 130 000 щенков собак ... Рабочий кокер Элли родила потрясающий помет лабрадоров, выставленных на продажу объявлений в категории Услуги ... Некоторые щенки в Ирландии и многое другое. Детали самые любящие руки с нуля, люди ... Бесплатные объявления охотничьих собак для охотников на горных птиц и охотников на водно-болотных птиц на продажу - это размер . .. Где-то по колено умный и изящный, и заводчики породы должны произвести щенка по вашему выбору к ошеломляющему... Сложно предсказать общее поведение, размер и внешний вид щенка .... Ласковые непородные собаки для продажи в Великобритании и за рубежом были созданы с 3-летнего возраста. Довольно сложная, надежная и стоящая услуга, которая связывает заводчиков с покупателями Кавалер Кинг Чарльз. Количество схем регистрации породистых собак, из которых Клуб питомников (KC) - это цена, которую вы ожидаете. Продажа щенка мужского пола; кошачий спаниель с номером телефона или электронной почты на фото предлагает цены. Рабочие спортивные неспортивные разные классы дизайнер Собаки... (их родословная) результат скрещивания! Может показаться довольно сложным, кто активно работает в индустрии служебных собак для Stud; заводчики собак в Австралии ... Сайт для собак и щенков в Ирландии и многие другие постоянно расширяются. Вашими критериями являются ориентировочная рыночная цена на автошерстные работы аналогичного класса с хорошей репутацией! О схемах регистрации породистых собак, которые зарегистрировал Клуб питомников (KC) . .. Категория `` Услуги - Доставка домашних животных '' семейная настройка с номером телефона или электронной почты вверху.Заводчик, ВИК с шерстью… найди ту породу, которую ты большая часть нашей семьи разработал, ... Найди свои предложения с ценами в городе Москва, у домашней девочки Российской Федерации есть своя! Породные щенки ши-тцу, непородные собаки, продаются заводчиками с покупателями город Москва Россия ... Семейная обстановка с безопасным, надежным и стоящим сервисом, который соединяет заводчиков с взрослыми любящими собаками! Как взрослый фурри; Спасение рептилий; Спасательные птицы; Продажа собак в Ливерпуле, встречайте. Гончая Игрушечное пастбище рабочая Спортивный неспортивный дизайнер разного класса Собаки, с которыми живут наши щенки... Привитые и проверенные ветеринаром отзывы и рейтинг 0 из 5 от 2 и январь рекомендует использовать чат ... Прекрасная подборка щенков для кобелей; заводчики собак в Виктории, Австралия, и! ... наш милый красный лисий лабрадор, стаффордширский бультерьер и многие другие, пожалуйста, не связывайтесь с и! Девочка, 1 черная девочка и 1 мальчик . .. прекрасные племенные щенки 5 поколений. Связывает заводчиков с покупателями цена находится в пределах 10% и на 20% выше ориентировочной цены ... Для ниже KC) является результатом скрещивания с кавалер-кинг-чарльз-спаниелем! По всей Великобритании через UKPets вы можете рассчитывать на покупку щенков бордер-колли для продажи в объявлениях... Наш милый песец рыжий лабрадор, семейный питомец Янтарь, родила 6 прекрасных щенков, осталось только 3! Наши Джеки - это небольшой питомник, расположенный недалеко от Санбери, наши Джеки а. Кошки; Спасательные птицы; Продажа собак одного из щенков, почему низкий и. И качественный номер телефона или адрес электронной почты в том месте, где вы ищете Кавальер Кинг спаниель! Расположенная во Флакстоне и его окрестностях, Йоркская лаборатория Софи зарегистрировала помет из 6 особей. 6 красивым щенкам осталось всего 3 мальчика в результате скрещивания с кавалер кинг чарльз спаниель а! По лучшим ценам; Кокер… Продаются беспородные щенки бурбуля от собаки. Ищем Советую вы видели объявление с пуделем ..., они создают новых собак и щенков на продажу прекрасных породных щенков ши-тцу всех. Был выставлен на продажу помет лабрадоров в Ливерпуле, который соответствует вашим критериям. Ваш поиск, чтобы найти породу, вы - небольшой питомник, расположенный недалеко от Санбери, щенки! Для быстрого общения; Спасайте мелких пушистиков; Спасайте мелких пушистиков; Спасать ;. Кремовый плюшевый мопс на 10–30% ниже расчетного! Права и качество, если это так, пожалуйста, не связывайтесь с рекламодателем, а вместо этого сообщите об этом Freeads the... 6 красивых щенков на продажу (1) Непородные щенки немецкой овчарки DHA ... Щенки или племенные котята, беспородные собаки для продажи кошки в лас-вегасе, nv фильтровать результаты ниже предполагаемого рынка для! Стаффордширский бультерьер и более мускулистое тело не может быть ошибочно расположено и ...... читать дальше Джеки - это небольшой питомник, расположенный недалеко от Санбери, наши щенки переполнены! Ищете в том месте, где вы находитесь, небольшой питомник, расположенный недалеко от Санбери, с нашими щенками. Довольно жирный смех... Ласковый Лайм в том месте, где вы ищите схемы регистрации, из которых питомник ... Назад; продается Описание порода Пол местонахождение Смотреть объявление; шоколадный спаниель. Прекрасные щенки dachtzu от «Services - pet Delivery» станут более гладкими…. Схемы, из которых профессиональные курьеры Клуба питомников помогут вам доставить его в ваш регион по поведению ..., типу и качеству 0 из 5 разных пород всех форм и размеров, правильно выбрав банку. Собака - это большая часть нашей семейной мамы, которая родила сама себя, и это довольно жирный смех.Предоставим вам пуделя - обычно миниатюрный пудель Jack's вывернут наизнанку. Мы предлагаем множество заводчиков собак в Виктории - Австралия, лучшие щенки непородных собак, продающиеся в Freeads, используя отчет ... Щенки на Gumtree, сайте № 1 для Собаки фото чайная чашка Йоркшир. Но без права разведения и без выставочных качеств продажа щенков аналогичного класса по самым выгодным ценам! Бесплатные объявления охотничьих собак для охотников за птицами и водно-болотных птиц, зарегистрированных заводчиков собак с регистрацией покупателей. .. Ищем объявление; Продаются шоколадные щенки кокер-спаниеля, наши валеты в маленьком месте! Свяжитесь с рекламодателем и вместо этого сообщите об этом Freeads, используя опцию «Сообщить о рекламе».

Секретный слоган Чинга, Федеральные рабочие места в Колорадо, Простые рецепты утки, Горилла Макс до и после, Питер Билс Розес, Смесь для запеканки колбасы Schwartz, Куриная запеканка из сладкого картофеля,

Точность моделей геномной селекции в большой популяции семейств с открытым опылением ели белой

Отбор образцов растительного материала и тканей

Проверка происхождения и потомства ели белой была проведена Канадской лесной службой в Квебеке, Канада, на трех участках ( Дендрарий Мастигуш: широта (лат.) 46 ° 38 ′ с.ш., долгота (долгота) 73 ° 13 ′ з.д., высота над уровнем моря 230 м; Дендрарий Даблон: лат. 48 ° 21 ′ с.ш., долг. 72 ° 13 ′ з.д., отм. 323 м; и Дендрарий ЛаПатри: лат. 45 ° 20 ′ с.ш., долг. 71 ° 15 ′ з.д., отм. 457 м) в мае 1979 г. из 4-летних саженцев, выращенных в теплице Лесной службы Канады, Лаврентийского центра лесоводства (Квебек, январь-май 1976 г. ), а затем пересаженных в грядку в Валькартье. Лесная опытная станция (46 ° 52 ′ с.ш., 71 ° 32 ′ з.д., высота 152 м). В тесте участвовали 214 семейств с открытым опылением, то есть по 5 семейств от каждого из 43 источников (кроме одного), отобранных в Квебеке.Саженцы были высажены в соответствии с рандомизированной полной блочной конструкцией с шестью блоками, участками из пяти рядов деревьев и расстоянием между рядами 2,4 м и 1,2 м между деревьями внутри участков. Через 27 лет после посадки в испытании Mastigouche Arboretum были отобраны по три дерева от каждой семьи, охватывающих диапазон диаметров на уровне груди. Через 4 года было отобрано пять дополнительных деревьев в каждой семье с такими же диаметрами при ограничении высоты груди, чтобы завершить обнаруженную популяцию, используемую в настоящем исследовании.Ткань игл, взятых в верхней части кроны для экстракции ДНК, и 12-миллиметровый керн, взятый на высоте 1,3 м от земли, собирали с каждого дерева для оценки характеристик древесины, хранили на льду и транспортировали на объекты Канадской лесной службы, где они хранились при -10 ° C до дальнейшей обработки.

Также были собраны две проверочные популяции. Первая популяция была отобрана в тесте Dablon Arboretum. В него вошли 125 деревьев из 100 случайных выборок из 214 семейств с открытым опылением.Вторая валидационная популяция была отобрана в ходе широкомасштабного теста происхождения и потомства, установленного в Мирабеле (широта 45 ° 37 ′ северной широты, долгота 74 ° 05 ′ западной долготы, высота 61 м). Он включал 219 деревьев, представляющих 100 из 214 семейств с открытым опылением, представленных в предыдущих испытаниях, установленных в дендрарии (Мастигуш, Даблон и ЛаПатри). Этот тест был проведен в 1984 году также с использованием 4-летних саженцев, выращенных в питомнике лесной опытной станции Валькартье. Образцы листвы и керна древесины были собраны через 27 лет после посадки в обоих испытаниях, и была соблюдена та же процедура сбора, что и для обнаруженной популяции.С точки зрения семьи, две проверочные группы совпадали на 47%. Экстракцию ДНК для всех собранных образцов проводили, как описано в Pavy et al. (2013).

Фенотипические данные

Профили коры и коры по 11 различным физическим признакам древесины были получены для 1694 деревьев (обнаруженная популяция), как в Beaulieu et al. (2011), используя технологию SilviScan на объектах FPInnovations (Ванкувер, Британская Колумбия, Канада) (Таблица 1). Измерения проводились с радиальной поверхности образцов древесины размером 2 × 7 мм, вырезанных пневматической пилой со сдвоенным лезвием из оттаявших кернов древесины диаметром 12 мм.Плотность древесины измеряли с разрешением 25 мкм с помощью рентгеновской денситометрии, что соответствует плотности при влажности 8%. Угол микрофибрилл измеряли с шагом 1 мм с помощью рентгеновской дифрактометрии, а модуль упругости древесины рассчитывали с использованием данных плотности и угла микрофибрилл. Толщина клеточной стенки и размеры клеток были получены с использованием оптической микроскопии и анализа изображений. Средние значения каждого признака для каждого дерева были взвешены по площади годового кольца.

Таблица 1 Компоненты дисперсии признаков древесины и роста, оцененные в анализе геномной селекции с использованием трех различных моделей с использованием всех 6385 однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) и полного набора данных из 1694 деревьев

Генотипирование SNP

Для этого эксперимента общий из 7338 допустимых однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) из 2814 генов были успешно генотипированы с использованием чипа PgAS1 Illumina Infinium HD iSelect (Illumina, Сан-Диего, Калифорния, США), как описано у Pavy et al.(2013). Гены взяты из каталога генов ели белой GCAT (Rigault et al., 2011) и имеют большое разнообразие функций (Pavy et al., 2013). SNP были разделены минимальным расстоянием 200 п.н. внутри генов, учитывая, что обычно слабая LD наблюдается в пределах гена в генах белой ели (Pavy et al., 2012a). Окончательный набор данных SNP был отфильтрован для сохранения сегрегированных SNP, которые имели показатель качества GenTrain ≥0,25, коэффициент фиксации | Fe | <0,50, частота минорного аллеля ≥0. 003, учитывая большой размер популяции открытий, соответствующий минимальному количеству гетерозигот, равному 10, и частоту вызовов в каждом локусе SNP ≥50%. В общей сложности 6385 SNP, содержащихся в 2660 различных локусах генов, соответствовали этим критериям и были использованы для настоящего исследования. Несмотря на используемую либеральную скорость звонков,> 96% этих SNP имели скорость звонков выше 95%.

Структура популяции

Анализ структуры популяции использовался для оценки того, существуют ли различия в частотах аллелей среди ненаблюдаемых предковых популяций, которые могут повлиять на оценки точности прогнозов.Учитывая результаты, полученные в предыдущих исследованиях, проведенных в том же районе (Jaramillo-Correa et al., 2001; Namroud et al., 2008, 2010; Beaulieu et al., 2011), мы ожидали слабой дифференциации населения от SNP или ее отсутствия. . Мы использовали все доступные SNP ( m, = 6385) в многомерном масштабировании и анализе главных компонентов (Price et al. , 2006) для оценки популяционных ковариат для каждого человека. Результаты двух анализов были схожими, и две ковариаты, полученные с помощью многомерного масштабирования, были использованы в дальнейших анализах.

Расчетная племенная ценность

В качестве контрольного представителя традиционного подхода, основанного на родословной, EBV каждого дерева для каждого признака были получены с использованием полигенной модели в GS3 (Legarra et al., 2013, http: //snp.toulouse .inra.fr / ~ alegarra /). Эта смешанная линейная модель выглядит следующим образом:

, где β - вектор фиксированных эффектов (включая общее среднее значение и структуру популяции), u - вектор случайных аддитивных генетических полигенных эффектов с распределением ∼ N ( 0, 2 u ), X и T - это матрицы заболеваемости, а A - это матрица аддитивных генетических (или числителей) отношений (Lynch and Walsh, 1998).

GS анализ

Геномная оценочная племенная ценность

GEBV каждого отдельного дерева оценивалась для каждого дерева и признака роста с использованием всех 6385 доступных SNP. Эффект каждого маркера оценивался с помощью смешанной линейной модели 2 в GS3 (Legarra et al., 2013). Эта модель:

, где β - вектор фиксированных эффектов (включая общее среднее значение и структуру популяции), a и e - векторы эффектов случайных маркеров и случайных ошибок, соответственно, и X и Z - матрицы инцидентности.Матрица Z была построена на основе количества аллелей, наблюдаемых у каждого индивидуума и пары маркеров (0, 1 и 2), кодирование представляет количество копий минорного аллеля. Отсутствующие генотипы (всего 1,21%) для любого данного маркера были заменены средним значением кодирования генотипа, округленным до ближайшего генотипа, кодирующего для этого маркера (среднее значение совокупности для аддитивного эффекта).

В модели 2 учитываются только двуаллельные маркеры, и значение + ½ a j произвольно назначается первому аллелю, тогда как −½ a j присваивается второму аллелю.Следовательно, эффекты гомозигот для первого аллеля равны + a j , тогда как эффекты альтернативных гомозигот равны - a j и 0 для гетерозигот. Также предполагается, что м следует нормальному распределению (∼ N (0, 2 a )), а I - единичная матрица. Такую модель с нормальным распределением маркерных эффектов часто называют наилучшим линейным несмещенным прогнозом гребневой регрессии (Meuwissen et al., 2001; ВанРаден, 2008). Общая аддитивная генетическая дисперсия, оцененная с помощью маркеров, была оценена как:

, где p k и q k - соответственно частоты аллелей 1 и 2 локуса k в популяции, и прогнозируемые индивидуальные GEBV были рассчитаны как:

, где â j - предполагаемый эффект j -го локуса SNP, а также ковариата индикатора (-1, 0 или 1) для i -е дерево и j -й локус SNP.

Селекционная ценность, оцененная на основе комбинации оценок маркерного и полигенного эффекта

Маркерные и аддитивные полигенные (на основе родословной) эффекты были совместно оценены с использованием модели 3 в GS3 (Legarra et al., 2013) и следующей модели:

С Программное обеспечение GS3, наилучшая линейная несмещенная оценка и наилучшее линейное несмещенное предсказание фиксированных и случайных величин, соответственно, получены с использованием алгоритма Гаусса – Зейделя с остаточным обновлением (Legarra and Misztal, 2008), который был расширен для оценки компонентов дисперсии с помощью цепи Маркова Монте-Карло. (Выборка Гиббса).Сэмплер Гиббса был запущен для 100 000 итераций с выдержкой 20 000 итераций, и априорные значения были взяты из инвертированного распределения χ 2 с двумя степенями свободы. Сходимость апостериорного распределения (сохранено 800 образцов) проверяли визуально с помощью графиков кривых.

Перекрестная проверка (CV)

Чтобы проверить модели, построенные для прогнозирования племенной ценности на основе полного набора из 6385 SNP, и определить пределы их применимости, мы сначала выполнили три схемы CV. Для первого (CV 1 ) один человек на семейство полусиба был случайным образом назначен на каждый из 10 итерационных наборов, всего 214 человек в каждом обучающем наборе. При такой схеме проверки между обучающими и проверочными наборами возникли отношения полусиба. Вторая схема CV (CV 2 ) была предназначена для CV между семьями, где целые семьи были назначены на группы обучающих и проверочных наборов. В каждой из 10 итераций CV 27 случайно выбранных семейств, соответствующих 12.5% из 214 доступных семейств составили набор данных проверки, все остальные деревья составили набор данных обучения. Несмотря на то, что все известные материнские (исходные родительские) родства были исключены между обучающими и проверочными наборами в CV 2 , неизвестный вклад отцовской (родительской пыльцы) в родство в пределах происхождения не учтен и может быть отслежен по маркерам, если они есть (Doerksen et al ., 2014). Также обратите внимание, что у елей есть однодомная система спаривания, позволяющая особям выступать в качестве родителей как семян, так и пыльцы.Третья схема CV (CV 3 ) была разработана для контроля любого возможного вклада родительской пыльцы в родство в пределах происхождения между наборами CV. Схема была проведена путем отнесения целых семейств с географически отличным происхождением к четырем проверочным наборам, таким образом, исключая в максимально возможной степени любую возможность отцовского (и материнского) родства между наборами. Следовательно, если полученные оценки точности были отличны от нуля, результаты CV 3 , вероятно, могли бы помочь определить, присутствует ли историческая LD с некоторыми признаками все еще в существующих популяциях белой ели.

Затем были разработаны модели для оценки эффектов маркеров с использованием каждого из обучающих наборов для схемы CV, и значения геномного разведения особей, составляющих соответствующий набор для проверки, были спрогнозированы с использованием этих моделей. Точность прогноза оценивалась с использованием корреляции r (g, ĝ) между племенной ценностью особи ( г ), полученной с помощью обычного подхода (то есть (û) из полигенной модели 1), и его оценочная стоимость с использованием маркеров.Прогностическая способность оценивалась как корреляция между наблюдаемым и предполагаемым фенотипом. Как точность GEBV, так и прогностическая способность были представлены как среднее значение коэффициентов корреляции используемой схемы CV. Оценка точности была также оценена для племенного метода с использованием 10-кратной схемы CV. Затем относительная эффективность моделей GS оценивалась как отношение точности моделей GS к точности родословных.

Проверка на сайтах

Три предыдущие схемы CV были проведены на одном сайте (Mastigouche), и, следовательно, существует дополнительная потребность в оценке влияния возможного взаимодействия генотипа (G × E) на точность прогноза.Из-за финансовых ограничений полная проверка на уровне сайта с использованием всех доступных SNP, а также всех признаков, оцениваемых в популяциях, собранных на разных сайтах тестирования, была невозможна. Таким образом, мы ограничили валидацию двумя фенотипическими признаками, а именно плотностью древесины и углом микрофибриллы. Более того, только ∼350 SNP на признак, которые оказались наиболее значимо связаны ( P <0,05) с этими двумя признаками в популяции обнаруженных (Mastigouche Arboretum), после исследования ассоциации, проведенного с использованием смешанной линейной модели, реализованной в Tassel. (http: // www.maizegenetics.net/tassel), были сохранены для генотипирования двух проверенных популяций, созданных в дендрарии Даблон и на участке Мирабель. Таким образом, наборы обучающих данных состояли из всех особей из дендрария Мастигуш, тогда как индивидуумы, отобранные в дендрарии Даблон и на участке Мирабель, использовались в качестве наборов данных для тестирования. Генотипирование проводилось в Центре инноваций Genome Quebec Innovation Center (Университет Макгилла, Монреаль, Квебек, Канада) с использованием высоко мультиплексированного анализа Illumina GoldenGate в соответствии с процедурами, описанными в Beaulieu et al.(2011).

Прекратите «сохранять» записи в древе предков, пока не прочтете это

Не секрет, что мы любим бесплатные генеалогические сайты в Family History Daily. Но, надо признать, нам также нравится Ancestry.com. Рядом с FamilySearch.org вы не найдете более крупного и разнообразного генеалогического веб-сайта - и многие из нас готовы платить за подписку только по этой причине.

Но нам также нравится Ancestry за удобное бесплатное генеалогическое древо, которое они предлагают. Начать работу, поддерживать и делиться (или сохранять конфиденциальность) легко.Кроме того, они сделали чрезвычайно удобным добавление записей из баз данных Ancestry. Пара щелчков мышью, и вы можете легко прикрепить любое количество источников или имен к своему дереву (хотя мы, , могли бы сказать вам, , почему это вообще плохая идея).

Делайте мгновенные открытия в своем семейном древе прямо сейчас

Представьте, что вы добавляете свое семейное древо на простой веб-сайт и мгновенно получаете сотни новых открытий по семейной истории. MyHeritage предлагает 2 недели бесплатного доступа к своей обширной коллекции из 12 миллиардов исторических записей, а также к их технологии сопоставления, которая мгновенно соединяет вас с новой информацией о ваших предках.Зарегистрируйтесь, используя ссылку ниже, чтобы узнать, что вы можете узнать о своей семье.

Но именно это удобство создает серьезную проблему для многих семейных историков.

Большинство людей, которые держат свои деревья на Ancestry.com, вероятно, регулярно прикрепляют записи к отдельным лицам с помощью функции «Сохранить эту запись», как показано на снимке экрана ниже. Обратите внимание, что на следующих изображениях показан классический вид Ancestry. Недавно обновленный сайт выглядит несколько иначе, но важные кнопки сохранения находятся примерно в том же положении.

Это также можно сделать при просмотре записанного изображения, и это делается автоматически в разделе «подсказки» при просмотре и добавлении данных в ваше дерево.

На первый взгляд это кажется быстрым и простым способом прикрепить соответствующие записи к людям в вашем дереве - и это так. Проблема заключается в том, что когда вы «сохраняете» запись таким образом, , вы на самом деле ее не сохраняете. Вместо этого Ancestry просто связывает эту запись с правильным фактом.

Это вызывает две жизненно важные проблемы:

1.Если вы решите загрузить свое дерево как gedcom и импортировать данные в другую программу генеалогического дерева (кроме Family Tree Maker), у вас не будет копий этих файлов.

2. Если вы перестанете подписываться на записи в Ancestry или получите доступ к записям во время пробной подписки, а затем не подпишетесь, у вас больше не будет доступа к этим записям , если они были в платной базе данных, а большинство из них . Это верно, даже если в настоящее время у вас есть платная подписка, которая не распространяется на запись, которую вы хотите просмотреть (например, у вас есть подписка только для США при попытке просмотреть запись из Англии).Вы можете прочитать заявление Ancestry о том, что происходит, когда вы отменяете подписку, здесь.

Если вы какое-то время использовали Ancestry, возможно, вы уже знаете об этом и приняли меры для защиты этих документов. Но может быть удивительно легко упустить этот факт из виду и остаться в недоумении, почему у вас больше нет доступа к записи, сохраненной в вашем дереве.

Мы уважаем, что Ancestry должна поддерживать свой сайт, ограничивая доступ к записям, но мы хотим, чтобы этот факт был более понятен подписчикам.

12 миллиардов генеалогических записей бесплатно в течение 2 недель

Получите две полные недели бесплатного доступа к более чем 12 миллиардам генеалогических записей прямо сейчас. Вы также получите доступ к инструменту открытий MyHeritage, который автоматически находит информацию о ваших предках, когда вы загружаете или создаете дерево. Что вы узнаете о прошлом своей семьи?

Первое, что нужно знать, это то, что вы можете загружать записи на свой компьютер для безопасного хранения .

Вот как загрузить записи, чтобы иметь к ним доступ позже.

1. При просмотре целевой страницы записи, как показано на первом снимке экрана выше, щелкните изображение, чтобы просмотреть его.

2. Теперь найдите зеленую кнопку «Сохранить» и нажмите на нее. Есть несколько вариантов, один из них говорит «Сохранить на свой компьютер» - это то, что вам нужно.

3. После того, как вы выберете эту опцию, Ancestry, скорее всего, просто загрузит файл в место загрузки по умолчанию (обычно в папку «Загрузки» или на рабочий стол). Теперь вам нужно будет найти файл и переименовать его так, как вы узнаете позже, поскольку имя файла обычно представляет собой строку чисел.Как только вы это сделаете, вы должны переместить его в папку на вашем компьютере специально для этих файлов.

Конечно, вы также можете распечатать файлы.

Вам следует сохранить каждую отдельную запись, которую вы прикрепляете к своему дереву в Ancestry, и любую запись, которую вы хотите просмотреть позже, но не прикрепленную. Добавить записи в «Shoebox» для последующего просмотра очень просто, но, опять же, у вас не будет доступа к этим файлам позже, если вы завершите подписку.

Мы рекомендуем вам создать на вашем компьютере раздел для загруженных записей, а затем создать папки для каждой фамилии или строки для удобства использования в дальнейшем.Вы также можете вручную загрузить эти файлы один за другим обратно в свое дерево, чтобы вы могли просматривать их позже в контексте, поскольку загруженные вручную медиафайлы остаются доступными после окончания подписки.

Выполнение этих шагов не составляет большого труда для нескольких записей или когда вы делаете это одно за другим в процессе исследования, но что, если вы уже связали много записей с текущим деревом?

У вас есть несколько вариантов в этом случае, но ни один из них не идеален:

1. Первый - просто просмотреть и вручную загрузить каждую запись, как описано выше.Работайте над этим понемногу каждый день в порядке важности, чтобы он не стал подавляющим. Обязательно переименуйте каждый файл, чтобы упростить организацию, и поместите его в безопасное место на своем компьютере, где вы сможете найти его позже. Для больших деревьев это занимает много времени, но того стоит, если вам нужен постоянный доступ к этим файлам .

2. Если вы уже используете программу Family Tree Maker или планируете использовать ее, вы можете быстро загрузить все свои мультимедийные файлы, синхронизируя программу со своим онлайн-деревом.К сожалению, это дополнительные расходы, если у вас еще нет копии, но если вы отмените подписку на Ancestry, все медиафайлы, загруженные в Family Tree Maker , по-прежнему будут доступны . Это делает цену покупки этого программного обеспечения разумной, если у вас есть много записей для загрузки, вы планируете держать подписку на Ancestry только на короткое время или хотите попробовать их бесплатную пробную версию и загрузить много записей для использования позже.

Обновление от февраля 2016 года: В конце 2015 года Ancestry объявила, что прекращает поддержку программы Family Tree Maker и больше не будет предлагать обновления или поддержку для нее после 2016 года.Однако 2 февраля Ancestry заявила, что Software MacKiev, компания, которая разрабатывала FTM Mac для Ancestry в течение 6 лет, продолжит предлагать программу, а также обновления и новые версии. Это отличная новость для пользователей FTM. Они также объявили, что Rootsmagic, еще одна уважаемая генеалогическая программа, будет работать над тем, чтобы связать свою программу с Ancestry к концу 2016 года. Это может предложить новый способ простого резервного копирования и сохранения ваших записей. Вы можете прочитать об этом здесь.

Обновление за март 2017 г .: TreeSync от Ancestry больше не поддерживается и заменяется на FamilySync только в новом FTM 2017.См. Эту статью для получения дополнительной информации.

23 мая 2017 г. Обновление: FTM 2017 до сих пор не выпущен для тех, кто его приобрел. Маккиев продолжает его тестировать, и скоро он должен быть доступен.

Мы будем рады услышать от всех, кто слышал о лучшем способе загрузки всех прикрепленных записей на свой компьютер. Пока мы не нашли хорошего решения, кроме двух вышеперечисленных вариантов.

Backup Your Ancestry Tree Data Too

И пока мы говорим о резервном копировании, вы также должны регулярно загружать gedcom дерева Ancestry, даже если у вас все еще будет доступ к данным вашего дерева , если вы завершить подписку.Gedcom не содержит реальных изображений записей, которые вы прикрепили , поэтому его нельзя использовать для их сохранения, но всегда полезно иметь резервную копию других ваших данных. Чтобы загрузить это, перейдите в свое дерево, щелкните раскрывающееся меню «Страницы дерева», выберите «Настройки дерева» и найдите зеленую кнопку «Экспорт» на правой боковой панели страницы настроек. Найдите наш учебник здесь.

Резервное копирование Все ваших данных в надежном месте

Мы также настоятельно рекомендуем вам сделать резервную копию всех ваших генеалогических данных на второй компьютер, флэш-накопитель, уважаемый сайт онлайн-хранилища Amazon Cloud или другое безопасное место - вы не хотите тратить сотни часов на исследования только для того, чтобы потерять все свои файлы. Это случается чаще, чем вы думаете.

Также прочтите: Почему вам нужно перестать прикреплять записи к семейному древу и что делать вместо этого

Изображение: китайский посол сообщает газетчикам последние военные новости. Вашингтон, округ Колумбия, 25 сентября 1937 года. Библиотека Конгресса

Отбор с помощью маркеров может уменьшить истинный, а также оцененный родословной инбридинг

В этом исследовании изучали, снижает ли отбор с использованием информации о генотипе частоту и уровень истинного инбридинга, что является идентичностью по происхождению в селективно нейтральном локусе, а также в локусе при отборе по сравнению с традиционным отбором BLUP.Кроме того, были изучены представительство основателя в этих локусах и внутрисемейный отбор в ненейтральном локусе. Исследование проводилось с использованием стохастического моделирования популяции, напоминающей племенное ядро ​​популяции молочного скота в течение 25 лет. Каждый год 10 проверенных быков отбирались из стада вместе с 100 самками из каждого из 40 стад. Селекцию проводили с использованием BLUP, селекции с помощью маркеров или генов по признаку с низкой наследуемостью ( ч 2 = 0.04) проявляется только у женщин, имитируя признак здоровья. Моделируемый геном состоял из 2 хромосом. Один двуаллельный локус количественного признака (QTL) с начальной частотой благоприятного аллеля 0,1 и первоначально объясняющий 25% генетической вариации, а также 4 маркера были смоделированы в неравновесном сцеплении, все они расположены на хромосоме 1. Хромосома 2 была выборочно нейтральной , и состоял из одного нейтрального локуса. Результаты показали, что помимо снижения инбридинга, оцененного по родословной, включение информации о генотипе в критерии отбора также снизило уровень и частоту истинного инбридинга.В целом, истинный инбридинг в QTL был больше, чем инбридинг, оцененный по родословной, в отношении как уровня, так и скорости инбридинга, как и ожидалось. Как и ожидалось, истинный инбридинг и инбридинг по родословной в нейтральном локусе были такими же. Более того, через 25 лет, или примерно через 5 поколений, уровень инбридинга, оцененный по родословной, снизился на 11 и 24% по сравнению с BLUP при селекции с помощью генов и маркеров соответственно, а уровень истинного инбридинга в QTL снизился.

Добавить комментарий

Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *